RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
FCHO1-230ENST00000600058 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-230ENST00000600058 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-230ENST00000600058 MRC1P22897 1456 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-230ENST00000600058 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-230ENST00000600058 IL13P35225 146 aa23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-230ENST00000600058 RASSF7Q02833 373 aa23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-230ENST00000600058 NFIXQ14938 502 aa23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-230ENST00000600058 NARFQ9UHQ1 456 aa23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-230ENST00000600058 LMNB1P20700 586 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-230ENST00000600058 COL15A1P39059 1388 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-230ENST00000600058 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.08■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 GLTPD2A6NH11 291 aa23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 LGR6Q9HBX8 967 aa23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 PRELPP51888 382 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 SERPINB2P05120 415 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 SLC39A6Q13433 755 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 TTLL6Q8N841 843 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.03■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.02■■□□□ 1.28
FCHO1-230ENST00000600058 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-230ENST00000600058 TNS4Q8IZW8 715 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-230ENST00000600058 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-230ENST00000600058 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-230ENST00000600058 H0YIN7 160 aa23■■□□□ 1.27
FCHO1-230ENST00000600058 NFKBIEO00221 500 aa23■■□□□ 1.27
FCHO1-230ENST00000600058 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23■■□□□ 1.27
FCHO1-230ENST00000600058 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-230ENST00000600058 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-230ENST00000600058 CAPN15O75808 1086 aa22.97■■□□□ 1.27
FCHO1-230ENST00000600058 HMOX1P09601 288 aa22.96■■□□□ 1.27
FCHO1-230ENST00000600058 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
FCHO1-230ENST00000600058 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.96■■□□□ 1.27
FCHO1-230ENST00000600058 POTECB2RU33 542 aa22.95■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 SCN7AQ01118 1682 aa22.94■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 A0A087WZG4 1122 aa22.94■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 STARD3NLO95772 234 aa22.94■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.94■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.94■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.94■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.92■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.92■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 PDE6BP35913 854 aa22.91■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.91■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
FCHO1-230ENST00000600058 C21orf2O43822 256 aa22.89■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 ERFEQ4G0M1 354 aa22.89■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.89■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.88■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.88■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 CACNA1SQ13698 1873 aa22.88■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 CHADLQ6NUI6 762 aa22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF790Q6PG37 636 aa22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 SLX4Q8IY92 1834 aa22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 TEFQ10587 303 aa22.85■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.85■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 CREBZFQ9NS37 354 aa22.85■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 BCORQ6W2J9 1755 aa22.84■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 CNBD1Q8NA66 436 aa22.83■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 IL17REQ8NFR9 667 aa22.83■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 CNKSR1Q969H4 720 aa22.83■■□□□ 1.25
FCHO1-230ENST00000600058 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.82■■□□□ 1.24
FCHO1-230ENST00000600058 STYK1Q6J9G0 422 aa22.82■■□□□ 1.24
FCHO1-230ENST00000600058 SETDB2Q96T68 719 aa22.82■■□□□ 1.24
FCHO1-230ENST00000600058 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-230ENST00000600058 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-230ENST00000600058 CAMTA2O94983 1202 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-230ENST00000600058 POTEIP0CG38 1075 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-230ENST00000600058 POTEJP0CG39 1038 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-230ENST00000600058 SRGNP10124 158 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-230ENST00000600058 SOGA3Q5TF21 947 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-230ENST00000600058 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-230ENST00000600058 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-230ENST00000600058 SCN4AP35499 1836 aa22.8■■□□□ 1.24
FCHO1-230ENST00000600058 ST5P78524 1137 aa22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms