RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.23□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 PIK3R4Q99570 1358 aa7.23□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 TRIM66O15016 1216 aa7.23□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 NME9Q86XW9 330 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 NWD1Q149M9 1564 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 SSH2Q76I76 1423 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 HMMRO75330 724 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 TPM3P06753 285 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 RLBP1P12271 317 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 MAP3K9P80192 1104 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM57Q8N5G2 664 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.22□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.21□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 AMPHP49418 695 aa7.21□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.21□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.21□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 FEZ1Q99689 392 aa7.21□□□□□ -1.25
SEH1L-210ENST00000592582 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.21□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 MBD3O95983 291 aa7.21□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 MCTP1Q6DN14 999 aa7.21□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 TIGD1Q96MW7 591 aa7.21□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.21□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 IL13P35225 146 aa7.21□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.21□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 MST1RQ04912 1400 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 SEC24BO95487 1268 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 SMC5Q8IY18 1101 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 TMC2Q8TDI7 906 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 NLRP7Q8WX94 980 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 SNX21Q969T3 373 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 STK31Q9BXU1 1019 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 KCNJ4P48050 445 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 CHD1LQ86WJ1 897 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 APPP05067 770 aa7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC102AQ96A19 550 aa7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 VAMP4O75379 141 aa7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 FBXO41Q8TF61 875 aa7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.261e-6■■■□□ 15.6
SEH1L-210ENST00000592582 TBX22Q9Y458 520 aa7.19□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF445P59923 1031 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 USP19O94966 1318 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 GLI3P10071 1580 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 LTN1O94822 1766 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 NUCB1Q02818 461 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 NCAPD2Q15021 1401 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 FAM184AQ8NB25 1140 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 LNPKQ9C0E8 428 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 TSPY26PQ9H489 355 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 MBIPQ9NS73 344 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 METP08581 1390 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 ACEP12821 1306 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 ST18O60284 1047 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 OGFRQ9NZT2 677 aa7.18□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 PTPRCP08575 1304 aa7.17□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 RFX1P22670 979 aa7.17□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.17□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 TEX35Q5T0J7 233 aa7.17□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 PHF12Q96QT6 1004 aa7.17□□□□□ -1.26
SEH1L-210ENST00000592582 TNNQ9UQP3 1299 aa7.17□□□□□ -1.26
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