RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587215.1

PKN1-209, Transcript of protein kinase N1, humanhuman

TSL 3

Gene PKN1, Length 363 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1-209ENST00000587215 NARFQ9UHQ1 456 aa22.2■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.2■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 FCHSD2O94868 740 aa22.19■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 BCS1LQ9Y276 419 aa22.19■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 STARD3NLO95772 234 aa22.18■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.18■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.17■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 ATP10DQ9P241 1426 aa22.17■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.17■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 KCNQ3O43525 872 aa22.17■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 ADCY9O60503 1353 aa22.16■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 COL15A1P39059 1388 aa22.16■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 NFIXQ14938 502 aa22.16■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 BTBD11A6QL63 1104 aa22.15■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PKN1-209ENST00000587215 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.14■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 MCM10Q7L590 875 aa22.13■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 PIM2Q9P1W9 311 aa22.13■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 CHRNA5P30532 468 aa22.12■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.12■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 A1BGP04217 495 aa22.11■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 DCTN1Q14203 1278 aa22.11■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 A0A087WZG4 1122 aa22.1■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 SERPINB2P05120 415 aa22.1■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 USP16Q9Y5T5 823 aa22.09■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.08■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PKN1-209ENST00000587215 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.07■■□□□ 1.12
PKN1-209ENST00000587215 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.07■■□□□ 1.12
PKN1-209ENST00000587215 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.06■■□□□ 1.12
PKN1-209ENST00000587215 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.06■■□□□ 1.12
PKN1-209ENST00000587215 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.06■■□□□ 1.12
PKN1-209ENST00000587215 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PKN1-209ENST00000587215 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PKN1-209ENST00000587215 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.04■■□□□ 1.12
PKN1-209ENST00000587215 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PKN1-209ENST00000587215 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PKN1-209ENST00000587215 CAMTA2O94983 1202 aa22.03■■□□□ 1.12
PKN1-209ENST00000587215 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.03■■□□□ 1.12
PKN1-209ENST00000587215 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PKN1-209ENST00000587215 KIF3CO14782 793 aa22.01■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.01■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.01■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 NBPF26B4DH59 902 aa21.99■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 NEFMP07197 916 aa21.99■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.99■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 NBPF15Q8N660 670 aa21.99■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 H0YIN7 160 aa21.98■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 RALBP1Q15311 655 aa21.98■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 NFE2L2Q16236 605 aa21.98■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.98■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.98■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 TTLL6Q8N841 843 aa21.97■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 SETDB2Q96T68 719 aa21.97■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.97■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PKN1-209ENST00000587215 SCN7AQ01118 1682 aa21.95■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 PDE6BP35913 854 aa21.94■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.94■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 RNF181Q9P0P0 153 aa21.94■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 PRELPP51888 382 aa21.93■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.93■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.92■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.92■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.91■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 RASSF7Q02833 373 aa21.91■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 CNBD1Q8NA66 436 aa21.91■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.9■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.9■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 CEP350Q5VT06 3117 aa21.89■■□□□ 1.1
PKN1-209ENST00000587215 TOMM70O94826 608 aa21.89■■□□□ 1.09
PKN1-209ENST00000587215 HSPA6P17066 643 aa21.89■■□□□ 1.09
PKN1-209ENST00000587215 HLFQ16534 295 aa21.89■■□□□ 1.09
PKN1-209ENST00000587215 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.89■■□□□ 1.09
PKN1-209ENST00000587215 SBF1O95248 1867 aa21.88■■□□□ 1.09
PKN1-209ENST00000587215 NFKBIEO00221 500 aa21.88■■□□□ 1.09
PKN1-209ENST00000587215 RGL2O15211 777 aa21.88■■□□□ 1.09
PKN1-209ENST00000587215 LMNB1P20700 586 aa21.88■■□□□ 1.09
PKN1-209ENST00000587215 RIPK4P57078 832 aa21.88■■□□□ 1.09
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