RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 KIF3CO14782 793 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAF4-216ENST00000586813 TM4SF1P30408 202 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAF4-216ENST00000586813 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
TRAF4-216ENST00000586813 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAF4-216ENST00000586813 PIM2Q9P1W9 311 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAF4-216ENST00000586813 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
TRAF4-216ENST00000586813 HSPA6P17066 643 aa26.1■■□□□ 1.77
TRAF4-216ENST00000586813 SBF1O95248 1867 aa26.09■■□□□ 1.77
TRAF4-216ENST00000586813 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TRAF4-216ENST00000586813 NARFQ9UHQ1 456 aa26.09■■□□□ 1.77
TRAF4-216ENST00000586813 SCN7AQ01118 1682 aa26.09■■□□□ 1.77
TRAF4-216ENST00000586813 CHRNA5P30532 468 aa26.08■■□□□ 1.77
TRAF4-216ENST00000586813 NFIXQ14938 502 aa26.07■■□□□ 1.76
TRAF4-216ENST00000586813 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.07■■□□□ 1.76
TRAF4-216ENST00000586813 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.07■■□□□ 1.76
TRAF4-216ENST00000586813 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.05■■□□□ 1.76
TRAF4-216ENST00000586813 IL17REQ8NFR9 667 aa26.05■■□□□ 1.76
TRAF4-216ENST00000586813 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.05■■□□□ 1.76
TRAF4-216ENST00000586813 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
TRAF4-216ENST00000586813 TEFQ10587 303 aa26.04■■□□□ 1.76
TRAF4-216ENST00000586813 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.04■■□□□ 1.76
TRAF4-216ENST00000586813 STARD3NLO95772 234 aa26.03■■□□□ 1.76
TRAF4-216ENST00000586813 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.03■■□□□ 1.76
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF790Q6PG37 636 aa26.02■■□□□ 1.76
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 SERPINB2P05120 415 aa26■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 TOMM70O94826 608 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 CFAP53Q96M91 514 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 BCORQ6W2J9 1755 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 PRKAR2BP31323 418 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 RNF181Q9P0P0 153 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 A0A087WZG4 1122 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAF4-216ENST00000586813 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.95■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 WDR90Q96KV7 1748 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 BTBD11A6QL63 1104 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 RASSF7Q02833 373 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 NUDCQ9Y266 331 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 PPP2R1AP30153 589 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 APLP1P51693 650 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 TTLL6Q8N841 843 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 CACNA1SQ13698 1873 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 H0YIN7 160 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 KCNQ3O43525 872 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 A1BGP04217 495 aa25.89■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.743e-7■■□□□ 12.8
TRAF4-216ENST00000586813 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
TRAF4-216ENST00000586813 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.86■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 CAMTA2O94983 1202 aa25.86■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 LMNB1P20700 586 aa25.86■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 PRELPP51888 382 aa25.86■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.86■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.85■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 MCM10Q7L590 875 aa25.85■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.85■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 RRAGCQ9HB90 399 aa25.85■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 PDE6BP35913 854 aa25.84■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.84■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 USP16Q9Y5T5 823 aa25.84■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 NFKBIEO00221 500 aa25.83■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.83■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 SETDB2Q96T68 719 aa25.83■■□□□ 1.73
TRAF4-216ENST00000586813 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.82■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 FSTL1Q12841 308 aa25.82■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 CNBD1Q8NA66 436 aa25.82■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 SLX4Q8IY92 1834 aa25.81■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.8■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 DCTN1Q14203 1278 aa25.8■■□□□ 1.72
TRAF4-216ENST00000586813 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.8■■□□□ 1.72
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