RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 NACADO15069 1562 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 BNIP3LO60238 219 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 BMP4P12644 408 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 FOXK2Q01167 660 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 KLRG1Q96E93 195 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 CABP1Q9NZU7 370 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 ATP1A2P50993 1020 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF358Q9NW07 568 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 A0A1W2PNR3 127 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 POM121CA8CG34 1229 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 IGHA1P01876 353 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 USP17L3A6NCW0 530 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 USP17L4A6NCW7 530 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 ATP9BO43861 1147 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 USP3Q9Y6I4 520 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 ARAFP10398 606 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 CTBSQ01459 385 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 TEAD4Q15561 434 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 UCN2Q96RP3 112 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 C2CD2LO14523 706 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 FAM157BP0CG42 384 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 EPHA4P54764 986 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 FAM182BQ5T319 152 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 ZIC5Q96T25 663 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 GGA1Q9UJY5 639 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 AMPD1P23109 780 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 TNP2Q05952 138 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 M0R2N6 131 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 PIK3R2O00459 728 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 NOS2P35228 1153 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 LAMC2Q13753 1193 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC102BQ68D86 513 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 DCAF5Q96JK2 942 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 RRAGCQ9HB90 399 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 SERTM1A2A2V5 107 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 EPXP11678 715 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 ADH6P28332 368 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 TXLNAP40222 546 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 CLDN10P78369 228 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 TNS4Q8IZW8 715 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 NEURL1BA8MQ27 555 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 EML1O00423 815 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 CD33P20138 364 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 SIX5Q8N196 739 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 OGFOD1Q8N543 542 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 GLMNQ92990 594 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 EFSO43281 561 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms