RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578446.1

USP22-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 3

Gene USP22, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-208	ENST00000578446	USP16	Q9Y5T5	823 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	TJP1	Q07157	1748 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	C5	P01031	1676 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	VAMP4	O75379	141 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	AK7	Q96M32	723 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		13.71	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	GNPAT	O15228	680 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	A1BG	P04217	495 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	MYL6B	P14649	208 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	C4B	P0C0L5	1744 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	RREB1	Q92766	1687 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.67	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	NBPF26	B4DH59	902 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	ANXA1	P04083	346 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	NBPF14	Q5TI25	921 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	NBPF15	Q8N660	670 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	HYPK	Q9NX55	129 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	PHF14	O94880	888 aa		13.65	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	PDIA6	Q15084	440 aa		13.65	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	AKT1S1	Q96B36	256 aa		13.65	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
USP22-208	ENST00000578446	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	COL15A1	P39059	1388 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	RPS6KA4	O75676	772 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	ARX	Q96QS3	562 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	SSFA2	P28290	1259 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446		A0A087WZG4	1122 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	BCAR3	O75815	825 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	ADRA2B	P18089	450 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	FLII	Q13045	1269 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	SOCS7	O14512	581 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	SMIM5	Q71RC9	77 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	G2E3	Q7L622	706 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	MSH5	O43196	834 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	RFC4	P35249	363 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	PTPRC	P08575	1304 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	ZPR1	O75312	459 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP22-208	ENST00000578446	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USP22-208	ENST00000578446	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP22-208	ENST00000578446	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24

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