RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.76■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PROSER3Q2NL68 480 aa29.76■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.76■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCA3Q99758 1704 aa29.75■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAAF4Q8WXU2 420 aa29.75■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF2CQ99661 725 aa29.75■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DCAF5Q96JK2 942 aa29.74■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.73■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.73■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADCY9O60503 1353 aa29.72■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa29.72■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAK2O60296 914 aa29.72■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa29.71■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP8B2P98198 1209 aa29.71■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BEND3Q5T5X7 828 aa29.71■■■□□ 2.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP29.69■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STRN4Q9NRL3 753 aa29.69■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa29.68■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa29.68■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRC1P22897 1456 aa29.68■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C5P01031 1676 aa29.67■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HYPKQ9NX55 129 aa29.67■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa29.67■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTC22Q5TAA0 569 aa29.67■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTC5Q8N0Z6 440 aa29.67■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX11L8A8MPP1 907 aa29.66■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CABP4P57796 275 aa29.65■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP29.65■■■□□ 2.341e-7■□□□□ 8.3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EVA1CP58658 441 aa29.64■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KSR2Q6VAB6 950 aa29.64■■■□□ 2.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.63■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.63■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDIA6Q15084 440 aa29.63■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.63■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDC45O75419 566 aa29.61■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYL6BP14649 208 aa29.61■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IL2RBP14784 551 aa29.61■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRCC1Q9C099 1032 aa29.61■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa29.6■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAB3GAP1Q15042 981 aa29.59■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FMNL2Q96PY5 1086 aa29.59■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX58O95786 925 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SSH3Q8TE77 659 aa29.59■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARXQ96QS3 562 aa29.59■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP16Q9Y5T5 823 aa29.58■■■□□ 2.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PANK2Q9BZ23 570 aa29.57■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SRGAP3O43295 1099 aa29.56■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ALDH1L1O75891 902 aa29.56■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SDSP20132 328 aa29.55■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDE1AP54750 535 aa29.55■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.54■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POLA2Q14181 598 aa29.54■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIC3Q7Z5B4 369 aa29.54■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.54■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BTG4Q9NY30 223 aa29.53■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SURF6O75683 361 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSHZ3Q63HK5 1081 aa29.53■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRE11P49959 708 aa29.52■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COPS6Q7L5N1 327 aa29.52■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINS1Q8NG48 757 aa29.52■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OSBPL3Q9H4L5 887 aa29.52■■■□□ 2.32
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GBP4Q96PP9 640 aa29.51■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.5■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SALL3Q9BXA9 1300 aa29.5■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa29.5■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERVV-2B6SEH9 535 aa29.49■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MX1P20591 662 aa29.49■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GLI3P10071 1580 aa29.48■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FOXD4L1Q9NU39 408 aa29.48■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GRPEL1Q9HAV7 217 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GRM8O00222 908 aa29.47■■■□□ 2.31
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