RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.34■■□□□ 1.33
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SPNS3-204ENST00000575194 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
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SPNS3-204ENST00000575194 GNAI3P08754 354 aa23.33■■□□□ 1.32
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SPNS3-204ENST00000575194 CYP27B1O15528 508 aa23.32■■□□□ 1.32
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SPNS3-204ENST00000575194 NECTIN2Q92692 538 aa23.3■■□□□ 1.32
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SPNS3-204ENST00000575194 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.3■■□□□ 1.32
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SPNS3-204ENST00000575194 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS3-204ENST00000575194 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.27■■□□□ 1.32
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SPNS3-204ENST00000575194 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.19■■□□□ 1.3
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SPNS3-204ENST00000575194 ALDH1L1O75891 902 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS3-204ENST00000575194 SLC4A3P48751 1232 aa23.13■■□□□ 1.29
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SPNS3-204ENST00000575194 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.12■■□□□ 1.29
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SPNS3-204ENST00000575194 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS3-204ENST00000575194 BCL9O00512 1426 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS3-204ENST00000575194 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS3-204ENST00000575194 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS3-204ENST00000575194 RAB11FIP3O75154 756 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 ANXA1P04083 346 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.08■■□□□ 1.28
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