RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 OXER1Q8TDS5 423 aa11.07□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 CYP27B1O15528 508 aa11.06□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa11.06□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 APAF1O14727 1248 aa11.05□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.05□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 LY75O60449 1722 aa11.04□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 TJP1Q07157 1748 aa11.04□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 FCHSD2O94868 740 aa11.04□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 EVA1CP58658 441 aa11.04□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.04□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 TCP11L2Q8N4U5 519 aa11.04□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF521Q96K83 1311 aa11.04□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 DCTN1Q14203 1278 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 FAM182BQ5T319 152 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD3-211ENST00000561438 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 SLC34A2O95436 690 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 IL2RBP14784 551 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 BARGINQ6ZT62 677 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 RUNDC1Q96C34 613 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 NUDCQ9Y266 331 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 NFE2L2Q16236 605 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 KCPQ6ZWJ8 1503 aa11□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 NEUROD2Q15784 382 aa11□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 LGR6Q9HBX8 967 aa11□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa11□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 MAP3K5Q99683 1374 aa11□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 PHKG2P15735 406 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 MCM10Q7L590 875 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 IL17REQ8NFR9 667 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 GRXCR2A6NFK2 248 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 EVI5O60447 810 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 TATP17735 454 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 PTGER2P43116 358 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 CDCA7LQ96GN5 454 aa10.98□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 MAMSTRQ6ZN01 415 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF831Q5JPB2 1677 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 RREB1Q92766 1687 aa10.97□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 RIPK4P57078 832 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 GPIHBP1Q8IV16 184 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 WWC1Q8IX03 1113 aa10.96□□□□□ -0.65
TMOD3-211ENST00000561438 NUP188Q5SRE5 1749 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 DDB1Q16531 1140 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 LHX8Q68G74 356 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.95□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 ZBED9Q6R2W3 1325 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 RNMTO43148 476 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 KCNQ3O43525 872 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 KCNQ2O43526 872 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 POTEJP0CG39 1038 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 AKAP4Q5JQC9 854 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 MIS18AQ9NYP9 233 aa10.94□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 BCL9O00512 1426 aa10.93□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 C4AP0C0L4 1744 aa10.93□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 C4BP0C0L5 1744 aa10.93□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 GNAT3A8MTJ3 354 aa10.93□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 POTEB2H3BUK9 544 aa10.93□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 ZMYND10O75800 440 aa10.93□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF853P0CG23 659 aa10.93□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC27Q2M243 656 aa10.93□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 KRT24Q2M2I5 525 aa10.93□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 GAS2L2Q8NHY3 880 aa10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms