RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560622.5

USP3-AS1-207, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 508 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-207ENST00000560622 SCN7AQ01118 1682 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-207ENST00000560622 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-207ENST00000560622 FCHSD2O94868 740 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-207ENST00000560622 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.98■■□□□ 1.11
USP3-AS1-207ENST00000560622 CHRNA5P30532 468 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-207ENST00000560622 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.97■■□□□ 1.11
USP3-AS1-207ENST00000560622 COL15A1P39059 1388 aa21.97■■□□□ 1.11
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USP3-AS1-207ENST00000560622 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
USP3-AS1-207ENST00000560622 WDR90Q96KV7 1748 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-207ENST00000560622 BCORQ6W2J9 1755 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-207ENST00000560622 NFIXQ14938 502 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-207ENST00000560622 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-207ENST00000560622 PIM2Q9P1W9 311 aa21.94■■□□□ 1.1
USP3-AS1-207ENST00000560622 NARFQ9UHQ1 456 aa21.94■■□□□ 1.1
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USP3-AS1-207ENST00000560622 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-207ENST00000560622 IL17REQ8NFR9 667 aa21.93■■□□□ 1.1
USP3-AS1-207ENST00000560622 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.92■■□□□ 1.1
USP3-AS1-207ENST00000560622 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.92■■□□□ 1.1
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USP3-AS1-207ENST00000560622 PRELPP51888 382 aa21.91■■□□□ 1.1
USP3-AS1-207ENST00000560622 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
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USP3-AS1-207ENST00000560622 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.9■■□□□ 1.1
USP3-AS1-207ENST00000560622 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.89■■□□□ 1.1
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZPR1O75312 459 aa21.89■■□□□ 1.09
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USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.87■■□□□ 1.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 TOMM70O94826 608 aa21.87■■□□□ 1.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.87■■□□□ 1.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.87■■□□□ 1.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.86■■□□□ 1.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.86■■□□□ 1.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 SERPINB2P05120 415 aa21.85■■□□□ 1.09
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USP3-AS1-207ENST00000560622 RASSF7Q02833 373 aa21.85■■□□□ 1.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF790Q6PG37 636 aa21.84■■□□□ 1.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.84■■□□□ 1.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 RNF181Q9P0P0 153 aa21.84■■□□□ 1.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLX4Q8IY92 1834 aa21.84■■□□□ 1.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.83■■□□□ 1.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 KCNQ3O43525 872 aa21.83■■□□□ 1.09
USP3-AS1-207ENST00000560622 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-207ENST00000560622 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-207ENST00000560622 IFFO2Q5TF58 517 aa21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-207ENST00000560622 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-207ENST00000560622 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-207ENST00000560622 APLP1P51693 650 aa21.8■■□□□ 1.08
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USP3-AS1-207ENST00000560622 STARD3NLO95772 234 aa21.78■■□□□ 1.08
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USP3-AS1-207ENST00000560622 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-207ENST00000560622 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.77■■□□□ 1.08
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USP3-AS1-207ENST00000560622 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-207ENST00000560622 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.76■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.76■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.76■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 TTLL6Q8N841 843 aa21.76■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 USP16Q9Y5T5 823 aa21.75■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.75■■□□□ 1.07
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USP3-AS1-207ENST00000560622 A0A087WZG4 1122 aa21.74■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 PPP2R1AP30153 589 aa21.74■■□□□ 1.07
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USP3-AS1-207ENST00000560622 POTECB2RU33 542 aa21.73■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 LMNB1P20700 586 aa21.73■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 NUP98P52948 1817 aa21.72■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 FSTL1Q12841 308 aa21.72■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 BTBD11A6QL63 1104 aa21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 H0YIN7 160 aa21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-207ENST00000560622 GLTPD2A6NH11 291 aa21.7■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 MCM10Q7L590 875 aa21.7■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 DCTN1Q14203 1278 aa21.69■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 NBPF26B4DH59 902 aa21.68■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 NBPF15Q8N660 670 aa21.68■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 C21orf2O43822 256 aa21.66■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 PDE6BP35913 854 aa21.66■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
USP3-AS1-207ENST00000560622 JMYQ8N9B5 988 aa21.66■■□□□ 1.06
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