RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 ADAM23O75077 832 aa10.09□□□□□ -0.79
USP15-218ENST00000552346 ATP4AP20648 1035 aa10.09□□□□□ -0.79
USP15-218ENST00000552346 NLRP8Q86W28 1048 aa10.09□□□□□ -0.79
USP15-218ENST00000552346 SERTAD1Q9UHV2 236 aa10.09□□□□□ -0.79
USP15-218ENST00000552346 COL8A1P27658 744 aa10.08□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 ARAFP10398 606 aa10.07□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 SOX11P35716 441 aa10.07□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 TMEM229AB2RXF0 380 aa10.06□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 EPXP11678 715 aa10.06□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 GRIN2CQ14957 1233 aa10.06□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 NBPF1Q3BBV0 1214 aa10.06□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 LINC00114Q6XXX2 140 aa10.06□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 BTBD6Q96KE9 485 aa10.06□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 A0A1W2PNR3 127 aa10.05□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 NEURL1BA8MQ27 555 aa10.05□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.05□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 SUV39H2Q9H5I1 410 aa10.05□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 DCDC2BA2VCK2 349 aa10.04□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 A6NJY4 79 aa10.04□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 PIK3R2O00459 728 aa10.04□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 CDK2AP1O14519 115 aa10.04□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 MTFR1Q15390 333 aa10.04□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa10.04□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 PIK3CDO00329 1044 aa10.03□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 MAPTP10636 758 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 TATP17735 454 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 TNP2Q05952 138 aa10.03□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 MCM6Q14566 821 aa10.03□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 ZMYND15Q9H091 742 aa10.03□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 CABP1Q9NZU7 370 aa10.03□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
USP15-218ENST00000552346 GNB5O14775 395 aa10.02□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 CD33P20138 364 aa10.02□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 BAG6P46379 1132 aa10.02□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa10.02□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa10.02□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 USP3Q9Y6I4 520 aa10.02□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 ADH6P28332 368 aa10.01□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 EML3Q32P44 896 aa10.01□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 FAM182BQ5T319 152 aa10.01□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 ZIC5Q96T25 663 aa10.01□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 HCN2Q9UL51 889 aa10.01□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 GJA3Q9Y6H8 435 aa10.01□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 DGKGP49619 791 aa10□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 SKIP12755 728 aa9.99□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 CHSY3Q70JA7 882 aa9.99□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 KLF15Q9UIH9 416 aa9.99□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 NOD1Q9Y239 953 aa9.99□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 COG6Q9Y2V7 657 aa9.99□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 BACH1O14867 736 aa9.98□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 FAM157BP0CG42 384 aa9.98□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.98□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.98□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 GTF2IP78347 998 aa9.97□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 PSME1Q06323 249 aa9.97□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.97□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.97□□□□□ -0.81
USP15-218ENST00000552346 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.95□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 FURINP09958 794 aa9.95□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 TXLNAP40222 546 aa9.95□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.95□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 ALG2Q9H553 416 aa9.95□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 ZNF358Q9NW07 568 aa9.95□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 MARK1Q9P0L2 795 aa9.95□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 NCOA4Q13772 614 aa9.94□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.94□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 STRN4Q9NRL3 753 aa9.94□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 LAMC2Q13753 1193 aa9.93□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 CD163Q86VB7 1156 aa9.93□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 WWC1Q8IX03 1113 aa9.93□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.93□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.93□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 EFSO43281 561 aa9.92□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 XP32Q5T750 250 aa9.92□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 NOS2P35228 1153 aa9.91□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 CHRNA4P43681 627 aa9.91□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 TEAD4Q15561 434 aa9.91□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.91□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 USP17L5A8MUK1 530 aa9.9□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.9□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.9□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.9□□□□□ -0.82
USP15-218ENST00000552346 EPHA4P54764 986 aa9.89□□□□□ -0.83
USP15-218ENST00000552346 TBCELQ5QJ74 424 aa9.89□□□□□ -0.83
USP15-218ENST00000552346 TNS4Q8IZW8 715 aa9.89□□□□□ -0.83
USP15-218ENST00000552346 TRIM11Q96F44 468 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms