RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 VPS53Q5VIR6 699 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 JDP2Q8WYK2 163 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 CHD1O14646 1710 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 HIP1O00291 1037 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
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PTPRB-210ENST00000551525 RNF214Q8ND24 703 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 RASSF8Q8NHQ8 419 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 NYXQ9GZU5 481 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 MLH3Q9UHC1 1453 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 PDILTQ8N807 584 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 BTBD11A6QL63 1104 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 KIF5CO60282 957 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 RFX1P22670 979 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 MPNDQ8N594 471 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 ECE1P42892 770 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 NAIPQ13075 1403 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 IL2RBP14784 551 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 SART3Q15020 963 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ARAP3Q8WWN8 1544 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 PIK3C2GO75747 1445 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 CCT4P50991 539 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 SESN3P58005 492 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 DDX12PQ92771 950 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 PPP2R5AQ15172 486 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC57Q2TAC2 916 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 FEZ1Q99689 392 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ABCC11Q96J66 1382 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GUA9 196 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 MYO1BO43795 1136 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 WDR70Q9NW82 654 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 SOGA3Q5TF21 947 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 PTPRTO14522 1441 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 PRKAR2BP31323 418 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 NACAP1Q9BZK3 213 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 HMOX1P09601 288 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM29Q14134 588 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 APBB1O00213 710 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 PDE4AP27815 886 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 NBPF15Q8N660 670 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 DRC1Q96MC2 740 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 CEP89Q96ST8 783 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 MYO5CQ9NQX4 1742 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa7.38□□□□□ -1.23
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