RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CS-227ENST00000551441 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-227ENST00000551441 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-227ENST00000551441 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CS-227ENST00000551441 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CS-227ENST00000551441 NFIXQ14938 502 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-227ENST00000551441 KLRG1Q96E93 195 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-227ENST00000551441 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-227ENST00000551441 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CS-227ENST00000551441 PRELPP51888 382 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-227ENST00000551441 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-227ENST00000551441 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 FSTL1Q12841 308 aa21.94■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.94■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 NARFQ9UHQ1 456 aa21.94■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 COL15A1P39059 1388 aa21.94■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.94■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 CAPN15O75808 1086 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 SERPINB2P05120 415 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 PCNTO95613 3336 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CS-227ENST00000551441 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 TTLL6Q8N841 843 aa21.89■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.89■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.89■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 LMNB1P20700 586 aa21.88■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 JMYQ8N9B5 988 aa21.88■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 MRC1P22897 1456 aa21.88■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.87■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.86■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 GLTPD2A6NH11 291 aa21.86■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 H0YIN7 160 aa21.86■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 NFKBIEO00221 500 aa21.85■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.85■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.84■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.84■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.83■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.83■■□□□ 1.09
CS-227ENST00000551441 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.83■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 C21orf2O43822 256 aa21.82■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.82■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 POTECB2RU33 542 aa21.81■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.8■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 STARD3NLO95772 234 aa21.8■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 TNS4Q8IZW8 715 aa21.8■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 CACNA1SQ13698 1873 aa21.79■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.78■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 IL17REQ8NFR9 667 aa21.78■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 A0A087WZG4 1122 aa21.77■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 A1BGP04217 495 aa21.77■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 TEFQ10587 303 aa21.77■■□□□ 1.08
CS-227ENST00000551441 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.76■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 KCNQ3O43525 872 aa21.76■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 ERFEQ4G0M1 354 aa21.76■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 ZNF790Q6PG37 636 aa21.76■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 NPHP1O15259 732 aa21.75■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 PDE6BP35913 854 aa21.75■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.75■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.75■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 SCN7AQ01118 1682 aa21.75■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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CS-227ENST00000551441 POTEJP0CG39 1038 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 SLX4Q8IY92 1834 aa21.73■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.71■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 CAMTA2O94983 1202 aa21.71■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 CNBD1Q8NA66 436 aa21.71■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 SETDB2Q96T68 719 aa21.71■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CS-227ENST00000551441 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.7■■□□□ 1.06
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