RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549400.1

PTPRB-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRB, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-207ENST00000549400 KANK1Q14678 1352 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 KIF1BO60333 1816 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 PIK3C2GO75747 1445 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 RCCD1A6NED2 376 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
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PTPRB-207ENST00000549400 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRB-207ENST00000549400 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRB-207ENST00000549400 KIFC2Q96AC6 838 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRB-207ENST00000549400 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 ERVK-7P63135 1459 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 SMPD1P17405 629 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 PTGDRQ13258 359 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 FAM161AQ3B820 660 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRB-207ENST00000549400 ADGRG1Q9Y653 693 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-207ENST00000549400 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
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PTPRB-207ENST00000549400 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 PREX1Q8TCU6 1659 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRB-207ENST00000549400 RGS3P49796 1198 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 TAF3Q5VWG9 929 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 NLRP13Q86W25 1043 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 CEP120Q8N960 986 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 KCNV2Q8TDN2 545 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 MRS2Q9HD23 443 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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PTPRB-207ENST00000549400 YEATS2Q9ULM3 1422 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
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PTPRB-207ENST00000549400 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 TMF1P82094 1093 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
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PTPRB-207ENST00000549400 MAP7D2Q96T17 732 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 TERF2IPQ9NYB0 399 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 DLC1Q96QB1 1528 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 KIF13AQ9H1H9 1805 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 OATP04181 439 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 FLIIQ13045 1269 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 CDCA8Q53HL2 280 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-207ENST00000549400 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
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