RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.45■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 COL15A1P39059 1388 aa22.44■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 RALBP1Q15311 655 aa22.44■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.44■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.43■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 C4AP0C0L4 1744 aa22.43■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 A0A0G2JLW4 131 aa22.42■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 BCS1LQ9Y276 419 aa22.42■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.41■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.41■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 MCM10Q7L590 875 aa22.4■■□□□ 1.18
CASP9-211ENST00000546969 DPEP1P16444 411 aa22.39■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.39■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 TM4SF1P30408 202 aa22.38■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 PIM2Q9P1W9 311 aa22.38■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.38■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.38■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 DDR1Q08345 913 aa22.37■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 NFIXQ14938 502 aa22.35■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.35■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 DCTN1Q14203 1278 aa22.34■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 NPHP1O15259 732 aa22.33■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 KCNQ3O43525 872 aa22.33■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 SERPINB2P05120 415 aa22.33■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 NFE2L2Q16236 605 aa22.33■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.33■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CASP9-211ENST00000546969 A1BGP04217 495 aa22.32■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.32■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 C1QTNF8P60827 252 aa22.31■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 ATP10DQ9P241 1426 aa22.31■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 SETDB2Q96T68 719 aa22.3■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.3■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.3■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 USP16Q9Y5T5 823 aa22.3■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.29■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.29■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 H0YIN7 160 aa22.28■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 CHRNA5P30532 468 aa22.28■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.28■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 KCNA3P22001 575 aa22.27■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CASP9-211ENST00000546969 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.26■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.26■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 PDE6BP35913 854 aa22.25■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.25■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.25■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.25■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.25■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 CAMTA2O94983 1202 aa22.24■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 RIPK4P57078 832 aa22.24■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 ST5P78524 1137 aa22.24■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 TTLL6Q8N841 843 aa22.24■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 ADCY9O60503 1353 aa22.24■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 CNBD1Q8NA66 436 aa22.23■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.23■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.22■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.22■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.22■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.21■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 RGL2O15211 777 aa22.21■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.21■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CASP9-211ENST00000546969 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.2■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.19■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.19■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 SCN7AQ01118 1682 aa22.19■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.19■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.18■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.17■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 RUNDC1Q96C34 613 aa22.17■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 RNF181Q9P0P0 153 aa22.17■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 NBPF26B4DH59 902 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms