RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 ZPR1O75312 459 aa25.1■■□□□ 1.61
LTBR-211ENST00000543190 IL17REQ8NFR9 667 aa25.1■■□□□ 1.61
LTBR-211ENST00000543190 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
LTBR-211ENST00000543190 PIM2Q9P1W9 311 aa25.09■■□□□ 1.61
LTBR-211ENST00000543190 BCS1LQ9Y276 419 aa25.09■■□□□ 1.61
LTBR-211ENST00000543190 ZNF790Q6PG37 636 aa25.08■■□□□ 1.61
LTBR-211ENST00000543190 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.08■■□□□ 1.61
LTBR-211ENST00000543190 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.07■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 STARD3NLO95772 234 aa25.07■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 SCN7AQ01118 1682 aa25.07■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.06■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.06■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 CFAP53Q96M91 514 aa25.06■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.06■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 TEFQ10587 303 aa25.05■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.05■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 FCHSD2O94868 740 aa25.04■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 NFIXQ14938 502 aa25.04■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.04■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 KIF3CO14782 793 aa25.03■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 NUDCQ9Y266 331 aa25.03■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 A0A087WZG4 1122 aa25.02■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.02■■□□□ 1.6
LTBR-211ENST00000543190 PPP2R1AP30153 589 aa25■■□□□ 1.59
LTBR-211ENST00000543190 PRKAR2BP31323 418 aa25■■□□□ 1.59
LTBR-211ENST00000543190 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
LTBR-211ENST00000543190 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25■■□□□ 1.59
LTBR-211ENST00000543190 BCORQ6W2J9 1755 aa25■■□□□ 1.59
LTBR-211ENST00000543190 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
LTBR-211ENST00000543190 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.99■■□□□ 1.59
LTBR-211ENST00000543190 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.99■■□□□ 1.59
LTBR-211ENST00000543190 HSPA6P17066 643 aa24.98■■□□□ 1.59
LTBR-211ENST00000543190 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
LTBR-211ENST00000543190 SERPINB2P05120 415 aa24.97■■□□□ 1.59
LTBR-211ENST00000543190 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.97■■□□□ 1.59
LTBR-211ENST00000543190 RGL2O15211 777 aa24.96■■□□□ 1.59
LTBR-211ENST00000543190 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.95■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 CHRNA5P30532 468 aa24.95■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 TOMM70O94826 608 aa24.94■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 BTBD11A6QL63 1104 aa24.93■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.93■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.93■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.92■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.91■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.9■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 TTLL6Q8N841 843 aa24.89■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.89■■□□□ 1.58
LTBR-211ENST00000543190 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.89■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 CAMTA2O94983 1202 aa24.88■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.88■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.88■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.88■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 H0YIN7 160 aa24.87■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 KCNQ3O43525 872 aa24.87■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 A1BGP04217 495 aa24.87■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.86■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 PDE6BP35913 854 aa24.86■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.85■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.85■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 RNF181Q9P0P0 153 aa24.85■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.85■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 USP16Q9Y5T5 823 aa24.85■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 LMNB1P20700 586 aa24.84■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.84■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.83■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 MCM10Q7L590 875 aa24.83■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
LTBR-211ENST00000543190 APLP1P51693 650 aa24.82■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 SETDB2Q96T68 719 aa24.82■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.81■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 SLX4Q8IY92 1834 aa24.8■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 FSTL1Q12841 308 aa24.8■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.8■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 WDR90Q96KV7 1748 aa24.8■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.8■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 PRELPP51888 382 aa24.79■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 NFKBIEO00221 500 aa24.78■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 CNBD1Q8NA66 436 aa24.78■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.78■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 NUP98P52948 1817 aa24.77■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 NBPF26B4DH59 902 aa24.77■■□□□ 1.56
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