RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, human

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRJ-206	ENST00000534219	COL15A1	P39059	1388 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	NEFM	P07197	916 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PTPRJ-206	ENST00000534219	NARF	Q9UHQ1	456 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PTPRJ-206	ENST00000534219	DDR1	Q08345	913 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PTPRJ-206	ENST00000534219	KCNQ3	O43525	872 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PTPRJ-206	ENST00000534219	DPEP1	P16444	411 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PTPRJ-206	ENST00000534219	TM4SF1	P30408	202 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PTPRJ-206	ENST00000534219	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PTPRJ-206	ENST00000534219	DCTN1	Q14203	1278 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PTPRJ-206	ENST00000534219	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PTPRJ-206	ENST00000534219	BCS1L	Q9Y276	419 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PTPRJ-206	ENST00000534219	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PTPRJ-206	ENST00000534219	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PTPRJ-206	ENST00000534219		A0A087WZG4	1122 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PTPRJ-206	ENST00000534219	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
PTPRJ-206	ENST00000534219	RALBP1	Q15311	655 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PTPRJ-206	ENST00000534219	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PTPRJ-206	ENST00000534219	NFIX	Q14938	502 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PTPRJ-206	ENST00000534219	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PTPRJ-206	ENST00000534219	A1BG	P04217	495 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PTPRJ-206	ENST00000534219	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PTPRJ-206	ENST00000534219	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PTPRJ-206	ENST00000534219	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
PTPRJ-206	ENST00000534219	KCNA3	P22001	575 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	PIM2	Q9P1W9	311 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	USP16	Q9Y5T5	823 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	SERPINB2	P05120	415 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	ATP10D	Q9P241	1426 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	CHRNA5	P30532	468 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	NFE2L2	Q16236	605 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PTPRJ-206	ENST00000534219	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
PTPRJ-206	ENST00000534219	C1QTNF8	P60827	252 aa		33	■■■□□ 2.87
PTPRJ-206	ENST00000534219	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
PTPRJ-206	ENST00000534219	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PTPRJ-206	ENST00000534219	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
PTPRJ-206	ENST00000534219	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PTPRJ-206	ENST00000534219	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
PTPRJ-206	ENST00000534219	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
PTPRJ-206	ENST00000534219	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
PTPRJ-206	ENST00000534219	ADCY9	O60503	1353 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PTPRJ-206	ENST00000534219	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
PTPRJ-206	ENST00000534219	CAMTA2	O94983	1202 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PTPRJ-206	ENST00000534219	SETDB2	Q96T68	719 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PTPRJ-206	ENST00000534219	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PTPRJ-206	ENST00000534219	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PTPRJ-206	ENST00000534219	NPHP1	O15259	732 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PTPRJ-206	ENST00000534219	RIPK4	P57078	832 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PTPRJ-206	ENST00000534219		H0YIN7	160 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	NBPF26	B4DH59	902 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	NBPF15	Q8N660	670 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	SCN7A	Q01118	1682 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.85	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	TTLL6	Q8N841	843 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	CNBD1	Q8NA66	436 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	PDE6B	P35913	854 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PTPRJ-206	ENST00000534219	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
PTPRJ-206	ENST00000534219	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PTPRJ-206	ENST00000534219	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PTPRJ-206	ENST00000534219	ST5	P78524	1137 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PTPRJ-206	ENST00000534219	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PTPRJ-206	ENST00000534219	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	32.81	■■■□□ 2.84
PTPRJ-206	ENST00000534219	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PTPRJ-206	ENST00000534219	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PTPRJ-206	ENST00000534219	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
PTPRJ-206	ENST00000534219	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PTPRJ-206	ENST00000534219	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
PTPRJ-206	ENST00000534219	RNF181	Q9P0P0	153 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PTPRJ-206	ENST00000534219	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PTPRJ-206	ENST00000534219	RUNDC1	Q96C34	613 aa		32.76	■■■□□ 2.83

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