RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 COL15A1P39059 1388 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRU-209ENST00000526080 LMNB1P20700 586 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRU-209ENST00000526080 NFIXQ14938 502 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRU-209ENST00000526080 NARFQ9UHQ1 456 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRU-209ENST00000526080 ZPR1O75312 459 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRU-209ENST00000526080 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
PTPRU-209ENST00000526080 BCL2L12Q9HB09 334 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRU-209ENST00000526080 UBR2Q8IWV8 1755 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRU-209ENST00000526080 CARMIL3Q8ND23 1372 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRU-209ENST00000526080 CAPN15O75808 1086 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRU-209ENST00000526080 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
PTPRU-209ENST00000526080 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRU-209ENST00000526080 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRU-209ENST00000526080 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 POTECB2RU33 542 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 NFKBIEO00221 500 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 IL13P35225 146 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 AKAP4Q5JQC9 854 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 PANK3Q9H999 370 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 TTLL6Q8N841 843 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 LGR6Q9HBX8 967 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 SCN7AQ01118 1682 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 SERPINB2P05120 415 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 SLC39A6Q13433 755 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 VSIG10Q8N0Z9 540 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRU-209ENST00000526080 RNMTO43148 476 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRU-209ENST00000526080 MORC1Q86VD1 984 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRU-209ENST00000526080 H0YIN7 160 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRU-209ENST00000526080 EIF5P55010 431 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PTPRU-209ENST00000526080 LTBP3Q9NS15 1303 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRU-209ENST00000526080 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRU-209ENST00000526080 CREBZFQ9NS37 354 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRU-209ENST00000526080 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRU-209ENST00000526080 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 TBC1D9BQ66K14 1250 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 C21orf2O43822 256 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 PRR5LQ6MZQ0 368 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 CHADLQ6NUI6 762 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 BCORQ6W2J9 1755 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 POTEIP0CG38 1075 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 POTEJP0CG39 1038 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.81■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 ERFEQ4G0M1 354 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 BICDL1Q6ZP65 573 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 SLX4Q8IY92 1834 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 A0A087WZG4 1122 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 HMOX1P09601 288 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 PDE6BP35913 854 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 CNTNAP1P78357 1384 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 PASKQ96RG2 1323 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 STARD3NLO95772 234 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.79■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 CACNA1SQ13698 1873 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 SCN4AP35499 1836 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 DDNO94850 711 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 CCDC24Q8N4L8 307 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRU-209ENST00000526080 FOXN1O15353 648 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 STYK1Q6J9G0 422 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 TTC5Q8N0Z6 440 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 CAMTA2O94983 1202 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 SRGNP10124 158 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF790Q6PG37 636 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 CNBD1Q8NA66 436 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 CNKSR1Q969H4 720 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 SOGA3Q5TF21 947 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 LDHDQ86WU2 507 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRU-209ENST00000526080 IL17REQ8NFR9 667 aa18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms