RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 TM4SF1P30408 202 aa19.42■□□□□ 0.7
UBASH3B-202ENST00000525711 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
UBASH3B-202ENST00000525711 CAPN15O75808 1086 aa19.41■□□□□ 0.7
UBASH3B-202ENST00000525711 LMNB1P20700 586 aa19.41■□□□□ 0.7
UBASH3B-202ENST00000525711 USPL1Q5W0Q7 1092 aa19.41■□□□□ 0.7
UBASH3B-202ENST00000525711 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.41■□□□□ 0.7
UBASH3B-202ENST00000525711 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
UBASH3B-202ENST00000525711 RASSF7Q02833 373 aa19.4■□□□□ 0.7
UBASH3B-202ENST00000525711 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.4■□□□□ 0.7
UBASH3B-202ENST00000525711 GLTPD2A6NH11 291 aa19.39■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 COL15A1P39059 1388 aa19.39■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 UBR2Q8IWV8 1755 aa19.39■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 CACNA1SQ13698 1873 aa19.39■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 MRC1P22897 1456 aa19.38■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 MORC1Q86VD1 984 aa19.38■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 DNAJC10Q8IXB1 793 aa19.38■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 NARFQ9UHQ1 456 aa19.38■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 AKAP4Q5JQC9 854 aa19.37■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 TTLL6Q8N841 843 aa19.37■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa19.37■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 PRELPP51888 382 aa19.36■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 NFIXQ14938 502 aa19.36■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 PANK3Q9H999 370 aa19.36■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.36■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa19.36■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 H0YIN7 160 aa19.34■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 SERPINB2P05120 415 aa19.34■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 C2CD5Q86YS7 1000 aa19.34■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 SCN7AQ01118 1682 aa19.33■□□□□ 0.69
UBASH3B-202ENST00000525711 DPY19L2Q6NUT2 758 aa19.33■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa19.32■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa19.32■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 IL13P35225 146 aa19.31■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.31■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC39A6Q13433 755 aa19.3■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 LGR6Q9HBX8 967 aa19.3■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.3■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 NFKBIEO00221 500 aa19.29■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 RNMTO43148 476 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 BCL2L12Q9HB09 334 aa19.29■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 KNSTRNQ9Y448 316 aa19.29■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 CARMIL3Q8ND23 1372 aa19.29■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A087WZG4 1122 aa19.28■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 CANXP27824 592 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 STARD3NLO95772 234 aa19.27■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP19.27■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 SCN4AP35499 1836 aa19.27■□□□□ 0.68
UBASH3B-202ENST00000525711 PDE6BP35913 854 aa19.26■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 ERFEQ4G0M1 354 aa19.26■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 BICDL1Q6ZP65 573 aa19.26■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 TTC5Q8N0Z6 440 aa19.26■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 BCORQ6W2J9 1755 aa19.26■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 SLX4Q8IY92 1834 aa19.24■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 POTECB2RU33 542 aa19.24■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 HMOX1P09601 288 aa19.24■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 BRIP1Q9BX63 1249 aa19.24■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 CREBZFQ9NS37 354 aa19.24■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 C21orf2O43822 256 aa19.23■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 EIF5P55010 431 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 CHADLQ6NUI6 762 aa19.23■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 NPHP1O15259 732 aa19.22■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D9BQ66K14 1250 aa19.22■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 TAOK3Q9H2K8 898 aa19.22■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 LTBP3Q9NS15 1303 aa19.22■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
UBASH3B-202ENST00000525711 SOGA3Q5TF21 947 aa19.2■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 PRR5LQ6MZQ0 368 aa19.2■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 HEG1Q9ULI3 1381 aa19.19■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 ST5P78524 1137 aa19.19■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 TEFQ10587 303 aa19.19■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 CNBD1Q8NA66 436 aa19.19■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 CNKSR1Q969H4 720 aa19.19■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 IQCA1LA6NCM1 817 aa19.18■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 SETDB2Q96T68 719 aa19.18■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 STYK1Q6J9G0 422 aa19.17■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa19.17■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 DDNO94850 711 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF790Q6PG37 636 aa19.16■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC24Q8N4L8 307 aa19.16■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 CNTNAP1P78357 1384 aa19.16■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
UBASH3B-202ENST00000525711 LDHDQ86WU2 507 aa19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms