RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520038.1

ARF1P3-201, Transcript of ADP ribosylation factor 1 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene ARF1P3, Length 511 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1P3-201ENST00000520038 BCS1LQ9Y276 419 aa14.64□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.63□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.63□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 CHRNA5P30532 468 aa14.63□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 NFIXQ14938 502 aa14.63□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.63□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 COL15A1P39059 1388 aa14.62□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 KCNQ3O43525 872 aa14.62□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.62□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.62□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 NARFQ9UHQ1 456 aa14.62□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.61□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 PRELPP51888 382 aa14.61□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 SCN7AQ01118 1682 aa14.61□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.6□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 FCHSD2O94868 740 aa14.59□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
ARF1P3-201ENST00000520038 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 PPP2R1AP30153 589 aa14.58□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 ZNF790Q6PG37 636 aa14.58□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.58□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.57□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.57□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.57□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 PRKAR2BP31323 418 aa14.57□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.57□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 PIM2Q9P1W9 311 aa14.57□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 BCORQ6W2J9 1755 aa14.57□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.56□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.56□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.56□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 ZPR1O75312 459 aa14.55□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 A1BGP04217 495 aa14.55□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 SERPINB2P05120 415 aa14.55□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 HSPA6P17066 643 aa14.55□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.55□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 USP16Q9Y5T5 823 aa14.54□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 RASSF7Q02833 373 aa14.53□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.52□□□□□ -0.08
ARF1P3-201ENST00000520038 CAMTA2O94983 1202 aa14.52□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 DCTN1Q14203 1278 aa14.52□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 MCM10Q7L590 875 aa14.52□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.52□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.52□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 SLX4Q8IY92 1834 aa14.52□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 NFKBIEO00221 500 aa14.51□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 TEFQ10587 303 aa14.51□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa14.51□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 NBPF26B4DH59 902 aa14.5□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 STARD3NLO95772 234 aa14.5□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.5□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.5□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.5□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 NBPF15Q8N660 670 aa14.5□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.5□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.5□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 CACNA1SQ13698 1873 aa14.49□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 BTBD11A6QL63 1104 aa14.49□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 TOMM70O94826 608 aa14.49□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.49□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 RNF181Q9P0P0 153 aa14.49□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.49□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.49□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.48□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 PCNTO95613 3336 aa14.48□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 WDR90Q96KV7 1748 aa14.47□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 POTECB2RU33 542 aa14.47□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.47□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 A0A087WZG4 1122 aa14.46□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 TTLL6Q8N841 843 aa14.46□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 CFAP53Q96M91 514 aa14.46□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.46□□□□□ -0.09
ARF1P3-201ENST00000520038 HTRA3P83110 453 aa14.45□□□□□ -0.1
ARF1P3-201ENST00000520038 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.45□□□□□ -0.1
ARF1P3-201ENST00000520038 RRAGCQ9HB90 399 aa14.45□□□□□ -0.1
ARF1P3-201ENST00000520038 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
ARF1P3-201ENST00000520038 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
ARF1P3-201ENST00000520038 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.44□□□□□ -0.1
ARF1P3-201ENST00000520038 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
ARF1P3-201ENST00000520038 NUP98P52948 1817 aa14.43□□□□□ -0.1
ARF1P3-201ENST00000520038 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
ARF1P3-201ENST00000520038 H0YIN7 160 aa14.43□□□□□ -0.1
ARF1P3-201ENST00000520038 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
ARF1P3-201ENST00000520038 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
ARF1P3-201ENST00000520038 SRGNP10124 158 aa14.43□□□□□ -0.1
ARF1P3-201ENST00000520038 LMNB1P20700 586 aa14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms