RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.31■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 PROSER3Q2NL68 480 aa28.31■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 OSBPL3Q9H4L5 887 aa28.31■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 USP35Q9P2H5 1018 aa28.3■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.3■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 SSH3Q8TE77 659 aa28.29■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.29■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 SLC39A6Q13433 755 aa28.28■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 KSR2Q6VAB6 950 aa28.28■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 POLA2Q14181 598 aa28.27■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 BCL11AQ9H165 835 aa28.27■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.27■■■□□ 2.12
PDE4D-223ENST00000515011 ALDH1L1O75891 902 aa28.26■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.26■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 PDIA6Q15084 440 aa28.26■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 SDSP20132 328 aa28.25■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 PDE1AP54750 535 aa28.25■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.23■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.23■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.22■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.22■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.22■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 GLI3P10071 1580 aa28.21■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 RAB11FIP3O75154 756 aa28.2■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.2■■■□□ 2.11
PDE4D-223ENST00000515011 CABP4P57796 275 aa28.2■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 NFKBIBQ15653 356 aa28.2■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.2■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 MTX1Q13505 466 aa28.18■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 LINS1Q8NG48 757 aa28.18■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.18■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 KIF2CQ99661 725 aa28.18■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.18■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 SRGAP3O43295 1099 aa28.18■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 MX1P20591 662 aa28.18■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 CASC1Q6TDU7 716 aa28.18■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 SNX21Q969T3 373 aa28.18■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 STAP2Q9UGK3 403 aa28.18■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.18■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.17■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.16■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 HSCBQ8IWL3 235 aa28.16■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 UTYO14607 1347 aa28.15■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 AOX1Q06278 1338 aa28.15■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 IL2RBP14784 551 aa28.14■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
PDE4D-223ENST00000515011 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.13■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 USP16Q9Y5T5 823 aa28.13■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.12■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 PAPPAQ13219 1627 aa28.12■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.12■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.12■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.12■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.11■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 MYL6BP14649 208 aa28.11■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.11■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.11■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 GRM8O00222 908 aa28.11■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.1■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 USP26Q9BXU7 913 aa28.1■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa28.1■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 STRN4Q9NRL3 753 aa28.1■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 COPS6Q7L5N1 327 aa28.09■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 IGKV5-2P06315 115 aa28.09■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 EVA1CP58658 441 aa28.09■■■□□ 2.09
PDE4D-223ENST00000515011 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.07■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 REC8O95072 547 aa28.07■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.06■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 ERBB4Q15303 1308 aa28.06■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 ERC2O15083 957 aa28.06■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.06■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 SUCLG2Q96I99 432 aa28.06■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 KAZALD1Q96I82 304 aa28.05■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.04■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.04■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.04■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.04■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 TNS2Q63HR2 1409 aa28.03■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 MYD88Q99836 296 aa28.03■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 GCKRQ14397 625 aa28.02■■■□□ 2.08
PDE4D-223ENST00000515011 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa28.02■■■□□ 2.08
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