RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TNNQ9UQP3 1299 aa15.37■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 G2E3Q7L622 706 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KSR2Q6VAB6 950 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNAAF4Q8WXU2 420 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PIGBQ92521 554 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ITGB4P16144 1822 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HMMRO75330 724 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BCL9O00512 1426 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MYL6BP14649 208 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 F6X3S4 739 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ALDH1L1O75891 902 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GNAI2P04899 355 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATG3Q9NT62 314 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 USP16Q9Y5T5 823 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PAPPAQ13219 1627 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UBR2Q8IWV8 1755 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GCC1Q96CN9 775 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ASAP1Q9ULH1 1129 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATRNO75882 1429 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RGS12O14924 1447 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATP10DQ9P241 1426 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COPS6Q7L5N1 327 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINS1Q8NG48 757 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C5P01031 1676 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KCPQ6ZWJ8 1503 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANXA1P04083 346 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHDP01880 384 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDIA6Q15084 440 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PROSER3Q2NL68 480 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BEND3Q5T5X7 828 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SEPT12Q8IYM1 358 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANKRD44Q8N8A2 993 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATP6V1AP38606 617 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNAJC10Q8IXB1 793 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MEIS3Q99687 375 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADCY9O60503 1353 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A1BGP04217 495 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FBXO41Q8TF61 875 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARXQ96QS3 562 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C1orf115Q9H7X2 142 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SIK1P57059 783 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM196AQ6ZSG2 479 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMC5Q8IY18 1101 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GLI3P10071 1580 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PALLDQ8WX93 1383 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CEP85Q6P2H3 762 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MYD88Q99836 296 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 USP44Q9H0E7 712 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A087WZG4 1122 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GRM8O00222 908 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATP8B2P98198 1209 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NBPF26B4DH59 902 aa15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms