RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 PIM2Q9P1W9 311 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 NARFQ9UHQ1 456 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 COL15A1P39059 1388 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 TEFQ10587 303 aa22.74■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 CHRNA5P30532 468 aa22.73■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 NFIXQ14938 502 aa22.73■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 CFAP53Q96M91 514 aa22.73■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.73■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 STARD3NLO95772 234 aa22.71■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 PRKAR2BP31323 418 aa22.71■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 ZNF790Q6PG37 636 aa22.71■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.71■■□□□ 1.23
HERC3-211ENST00000513325 KIF3CO14782 793 aa22.7■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.7■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.69■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 NUDCQ9Y266 331 aa22.68■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.68■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 SERPINB2P05120 415 aa22.67■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 PPP2R1AP30153 589 aa22.67■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.67■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.66■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 A0A087WZG4 1122 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 KCNQ3O43525 872 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 HSPA6P17066 643 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.65■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HERC3-211ENST00000513325 BTBD11A6QL63 1104 aa22.64■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.63■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.62■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.62■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 A1BGP04217 495 aa22.61■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.61■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 RNF181Q9P0P0 153 aa22.61■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.6■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 TOMM70O94826 608 aa22.59■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 MCM10Q7L590 875 aa22.59■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.59■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 TTLL6Q8N841 843 aa22.58■■□□□ 1.21
HERC3-211ENST00000513325 H0YIN7 160 aa22.57■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 DCTN1Q14203 1278 aa22.57■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 USP16Q9Y5T5 823 aa22.57■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 RASSF7Q02833 373 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 CEP350Q5VT06 3117 aa22.56■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 SCN7AQ01118 1682 aa22.55■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.55■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 CAMTA2O94983 1202 aa22.55■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.55■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.54■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.53■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 SBF1O95248 1867 aa22.53■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 SETDB2Q96T68 719 aa22.52■■□□□ 1.2
HERC3-211ENST00000513325 LMNB1P20700 586 aa22.51■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 PDE6BP35913 854 aa22.51■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 PRELPP51888 382 aa22.51■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 RRAGCQ9HB90 399 aa22.51■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.5■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 CNBD1Q8NA66 436 aa22.5■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.5■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 NPHP1O15259 732 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 APLP1P51693 650 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 NFKBIEO00221 500 aa22.48■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 NBPF26B4DH59 902 aa22.47■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 NEFMP07197 916 aa22.47■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 NBPF15Q8N660 670 aa22.47■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 BCORQ6W2J9 1755 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 C21orf2O43822 256 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 ST5P78524 1137 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC3-211ENST00000513325 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.45■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.45■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
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