RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 CDK15Q96Q40 435 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ICMTO60725 284 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 LILRA1O75019 489 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 BMP1P13497 986 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD33BA6NCL7 494 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 DKK1O94907 266 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 NNTQ13423 1086 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 RNF20Q5VTR2 975 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 FBXO33Q7Z6M2 555 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 GIPC2Q8TF65 315 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 CITED4Q96RK1 184 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 DCTN4Q9UJW0 460 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 IRS1P35568 1242 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 AGBL1Q96MI9 1066 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 OSBPL3Q9H4L5 887 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 C21orf2O43822 256 aa3.4□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 NBPF20Q3BBV1 942 aa3.4□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 CAPN12Q6ZSI9 719 aa3.4□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 TIMP2P16035 220 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 NPR3P17342 541 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 NCLP19338 710 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 TXKP42681 527 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 SEC13P55735 322 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 DPYDQ12882 1025 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 RGL4Q8IZJ4 473 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 OGFOD1Q8N543 542 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ARMC5Q96C12 935 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 DOLKQ9UPQ8 538 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 USP3Q9Y6I4 520 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 CADPSQ9ULU8 1353 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ERBB4Q15303 1308 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC116Q8IYX3 515 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 GALNT6Q8NCL4 622 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 SFI1A8K8P3 1242 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 COBLO75128 1261 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 SCNN1DP51172 638 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 TBCELQ5QJ74 424 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 KLRG1Q96E93 195 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA32Q96LK8 384 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 SPOCK3Q9BQ16 436 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM229AB2RXF0 380 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 WDR4P57081 412 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ERVK-9P63128 1117 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 OCLNQ16625 522 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 GLYCTKQ8IVS8 523 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 SLC43A3Q8NBI5 491 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 SERPINB4P48594 390 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 SEPT12Q8IYM1 358 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 RBCK1Q9BYM8 510 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.872e-6■■■■■ 96.1
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PDE4D-218ENST00000509368 NLRP2Q9NX02 1062 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 FAM13AO94988 1023 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 GTF2IP78347 998 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 RELBQ01201 579 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 TPCN2Q8NHX9 752 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 ETNK1Q9HBU6 452 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 SOBPA7XYQ1 873 aa3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 FOXO3O43524 673 aa3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 MAPK1P28482 360 aa3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
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PDE4D-218ENST00000509368 UNC13AQ9UPW8 1703 aa3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 WEE1P30291 646 aa3.37□□□□□ -1.87
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PDE4D-218ENST00000509368 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 H3BRB1 525 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 RECKO95980 971 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 IL2RAP01589 272 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 NAALADL2Q58DX5 795 aa3.36□□□□□ -1.87
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PDE4D-218ENST00000509368 FRMD6Q96NE9 622 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-218ENST00000509368 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
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