RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CHMLP26374 656 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CORO7P57737 925 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TMED1Q13445 227 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 E2F5Q15329 346 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ST7Q9NRC1 585 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 MAPKBP1O60336 1514 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CNTLNQ9NXG0 1405 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 XBP1P17861 261 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ARMC3Q5W041 872 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 SH3BP5O60239 455 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 VDRP11473 427 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 NF2P35240 595 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 GJA8P48165 433 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 RNF20Q5VTR2 975 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ARL10Q8N8L6 244 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TIMM44O43615 452 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 NAT2P11245 290 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF24P17028 368 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 PYGLP06737 847 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 RLBP1P12271 317 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 COPB2P35606 906 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CLEC17AQ6ZS10 378 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 SPATA21Q7Z572 469 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 A0A1B0GUA9 196 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF394Q53GI3 561 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 FAM107BQ9H098 131 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 SASH1O94885 1247 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 GCKP35557 465 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ACTN2P35609 894 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 AKNAD1Q5T1N1 836 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 MYL1P05976 194 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 PYGBP11216 843 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 RAB27AP51159 221 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CDR1P51861 262 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TADA2BQ86TJ2 420 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 HSCBQ8IWL3 235 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 C3orf20Q8ND61 904 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 MCM8Q9UJA3 840 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 PTPRCP08575 1304 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 NCOA2Q15596 1464 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 APBB1O00213 710 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 DDIT3P35638 169 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 SLC7A5Q01650 507 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TTC30AQ86WT1 665 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 WDR63Q8IWG1 891 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC112Q8NEF3 446 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TCP11Q8WWU5 503 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TBC1D5Q92609 795 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 SPATA7Q9P0W8 599 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 F8VZ95 297 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 IGHDP01880 384 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 DEUP1Q05D60 604 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 SFMBT2Q5VUG0 894 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 KIAA1328Q86T90 577 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TAF4BQ92750 862 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 BHMTQ93088 406 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 SMARCE1Q969G3 411 aa7.22□□□□□ -1.25
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