RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0G2JLW4 131 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEFMP07197 916 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FMNL2Q96PY5 1086 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C10orf71Q711Q0 1435 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL15A1P39059 1388 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MCM10Q7L590 875 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NARFQ9UHQ1 456 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PXDNLA1KZ92 1463 aa31.02■■■□□ 2.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDR1Q08345 913 aa31.01■■■□□ 2.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNQ3O43525 872 aa31■■■□□ 2.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TM4SF1P30408 202 aa31■■■□□ 2.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 DPEP1P16444 411 aa30.99■■■□□ 2.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCTN1Q14203 1278 aa30.99■■■□□ 2.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCS1LQ9Y276 419 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A087WZG4 1122 aa30.97■■■□□ 2.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa30.97■■■□□ 2.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF5P55010 431 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RALBP1Q15311 655 aa30.96■■■□□ 2.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NFIXQ14938 502 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A1BGP04217 495 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCL2L12Q9HB09 334 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLEKHF1Q96S99 279 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIM2Q9P1W9 311 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP16Q9Y5T5 823 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNA3P22001 575 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BICDL1Q6ZP65 573 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DLG5Q8TDM6 1919 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SERPINB2P05120 415 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHRNA5P30532 468 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NFE2L2Q16236 605 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP10DQ9P241 1426 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MIS18AQ9NYP9 233 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBC1D9BQ66K14 1250 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C1QTNF8P60827 252 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADCY9O60503 1353 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NRXN2Q9P2S2 1712 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCN7AQ01118 1682 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAMTA2O94983 1202 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SETDB2Q96T68 719 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIPK4P57078 832 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C2CD5Q86YS7 1000 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H0YIN7 160 aa30.74■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPHP1O15259 732 aa30.74■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CARMIL3Q8ND23 1372 aa30.74■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBPF26B4DH59 902 aa30.73■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBPF15Q8N660 670 aa30.73■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KDM3BQ7LBC6 1761 aa30.72■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP30.71■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRR5LQ6MZQ0 368 aa30.71■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC24Q8N4L8 307 aa30.71■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF652Q9Y2D9 606 aa30.71■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCORQ6W2J9 1755 aa30.7■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTLL6Q8N841 843 aa30.7■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BRIP1Q9BX63 1249 aa30.7■■■□□ 2.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDE6BP35913 854 aa30.69■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMPOP42166 694 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C9orf131Q5VYM1 1079 aa30.69■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLEC4GQ6UXB4 293 aa30.69■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC146Q8IYE0 955 aa30.69■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNBD1Q8NA66 436 aa30.69■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LMOD3Q0VAK6 560 aa30.68■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LAMB4A4D0S4 1761 aa30.68■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa30.67■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSPYL4Q9UJ04 414 aa30.67■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa30.67■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DLEC1Q9Y238 1755 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ST5P78524 1137 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEUROD2Q15784 382 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NGEFQ8N5V2 710 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP30.66■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
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