RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498834.5

VSTM2A-208, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 2

Gene VSTM2A, Length 803 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-208ENST00000498834 NSD2O96028 1365 aa9.55□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 AMPHP49418 695 aa9.55□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 EVA1CP58658 441 aa9.55□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 ITSN1Q15811 1721 aa9.55□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 PHLPP1O60346 1717 aa9.54□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.54□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 NHSL1Q5SYE7 1610 aa9.54□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 CHRNA2Q15822 529 aa9.54□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.53□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 FECHP22830 423 aa9.53□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 FBLN1P23142 703 aa9.53□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 RALBP1Q15311 655 aa9.53□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 IP6K1Q92551 441 aa9.53□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 ZNF516Q92618 1163 aa9.53□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 CPDO75976 1380 aa9.52□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 KIAA0232Q92628 1395 aa9.52□□□□□ -0.88
VSTM2A-208ENST00000498834 CFHP08603 1231 aa9.52□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 BTG4Q9NY30 223 aa9.52□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 POLKQ9UBT6 870 aa9.52□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 USP21Q9UK80 565 aa9.52□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 ANP32CO43423 234 aa9.51□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 ZPR1O75312 459 aa9.51□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 UNC5CLQ8IV45 518 aa9.51□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 RDH13Q8NBN7 331 aa9.51□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.51□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.5□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.5□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.5□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.5□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 MTHFSP49914 203 aa9.5□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.5□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 SULF1Q8IWU6 871 aa9.5□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 STRN4Q9NRL3 753 aa9.5□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 AFF2P51816 1311 aa9.5□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 HOXC9P31274 260 aa9.49□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.49□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.49□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.48□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 GPR37O15354 613 aa9.48□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 NR1I2O75469 434 aa9.48□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 SLC10A3P09131 477 aa9.48□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 PPP2R1AP30153 589 aa9.48□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa9.48□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.48□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 CFAP53Q96M91 514 aa9.48□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 VPS72Q15906 364 aa9.47□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.47□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.47□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.47□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.47□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 AKAP12Q02952 1782 aa9.47□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 LRP6O75581 1613 aa9.46□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 ALS2Q96Q42 1657 aa9.46□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.46□□□□□ -0.89
VSTM2A-208ENST00000498834 RXRBP28702 533 aa9.46□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.46□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 FLT4P35916 1363 aa9.46□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 SLIT3O75094 1523 aa9.46□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 MYOM1P52179 1685 aa9.45□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 SHPRHQ149N8 1683 aa9.45□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 MAP2K5Q13163 448 aa9.45□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.45□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 USP35Q9P2H5 1018 aa9.45□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 NUDCQ9Y266 331 aa9.45□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 WDR17Q8IZU2 1322 aa9.45□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 RTL1A6NKG5 1358 aa9.45□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 INSRP06213 1382 aa9.45□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.44□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.44□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.44□□□□□ -0.9
VSTM2A-208ENST00000498834 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms