RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 PTK7Q13308 1070 aa6.71□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 TEAD4Q15561 434 aa6.71□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.71□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 AIDAQ96BJ3 306 aa6.71□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.71□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 RUBCNLQ9H714 662 aa6.71□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.71□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.71□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 FAM196BA6NMK8 535 aa6.7□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 SFI1A8K8P3 1242 aa6.7□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 SLURP2P0DP57 97 aa6.7□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 ATP4AP20648 1035 aa6.7□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 GSK3AP49840 483 aa6.7□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 SEC13P55735 322 aa6.7□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.69□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.69□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 MBIPQ9NS73 344 aa6.69□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 PHF24Q9UPV7 400 aa6.69□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 SERTM1A2A2V5 107 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 USP17L15C9J2P7 530 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 USP17L10C9JJH3 530 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 USP17L12C9JPN9 530 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 USP17L11C9JVI0 530 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 USP17L21D6R901 530 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 USP17L18D6R9N7 530 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 USP17L22D6RA61 530 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 USP17L19D6RCP7 530 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 USP17L20D6RJB6 530 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 GDF11O95390 407 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 ADAMTS2O95450 1211 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 NOS2P35228 1153 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 USP17L24Q0WX57 530 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 TBCELQ5QJ74 424 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 NLRP8Q86W28 1048 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.68□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 A0A1W2PNR3 127 aa6.67□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 RASSF7Q02833 373 aa6.67□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 DPYDQ12882 1025 aa6.67□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.67□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.67□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 EML1O00423 815 aa6.66□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 MX2P20592 715 aa6.66□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 RFX1P22670 979 aa6.66□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 TXLNAP40222 546 aa6.66□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 ZIC5Q96T25 663 aa6.66□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.66□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.66□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.66□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 IGF1RP08069 1367 aa6.66□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 C21orf2O43822 256 aa6.65□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 POTEAQ6S8J7 498 aa6.65□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.65□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.65□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.65□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 ARXQ96QS3 562 aa6.65□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.65□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CMC1-211ENST00000495428 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 BNIP3LO60238 219 aa6.64□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 MAP2K3P46734 347 aa6.64□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 CDCA8Q53HL2 280 aa6.64□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.64□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 C14orf37Q86TY3 774 aa6.64□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 SVOPQ8N4V2 548 aa6.64□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 WHAMMQ8TF30 809 aa6.64□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.64□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 HINFPQ9BQA5 517 aa6.64□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.64□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.64□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 FGFR3P22607 806 aa6.63□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.63□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.63□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.63□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 ARID3CA6NKF2 412 aa6.62□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 IGHA1P01876 353 aa6.62□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 FAM157BP0CG42 384 aa6.62□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.62□□□□□ -1.35
CMC1-211ENST00000495428 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms