RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 PRR20EP86478 221 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 PRR20CP86479 221 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 PRR20DP86480 221 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 PRR20BP86481 221 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 PRR20AP86496 221 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 ALKBH2Q6NS38 261 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 MYO19Q96H55 970 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 AGBL1Q96MI9 1066 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 CABP1Q9NZU7 370 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF10AO00220 468 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 NOS2P35228 1153 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 ASB16Q96NS5 453 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 STIM2Q9P246 746 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF232Q9UNY5 417 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 SMPD1P17405 629 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 GPC1P35052 558 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 COX20Q5RI15 118 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 SAP130Q9H0E3 1048 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 USP3Q9Y6I4 520 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 EML1O00423 815 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 MPSTP25325 297 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 MEIOBQ8N635 442 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 ABTB2Q8N961 1025 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFB5O43674 189 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 RHBDD1Q8TEB9 315 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 BRD2P25440 801 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 NPAS4Q8IUM7 802 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 UPP2O95045 317 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 COL19A1Q14993 1142 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 GNASQ5JWF2 1037 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 SLC27A3Q5K4L6 730 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 CITED4Q96RK1 184 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 BRPF3Q9ULD4 1205 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 AAMPQ13685 434 aa12.8□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 RTN1Q16799 776 aa12.8□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 RGL4Q8IZJ4 473 aa12.8□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa12.8□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa12.8□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 NGLY1Q96IV0 654 aa12.8□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 RBCK1Q9BYM8 510 aa12.8□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF10BO14763 440 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf53Q5VUE5 145 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 GRIP2Q9C0E4 1043 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf91Q3C1V1 193 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 HPS1Q92902 700 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 LRFN2Q9ULH4 789 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM67Q6ZTA4 783 aa12.77□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 PHACTR1Q9C0D0 580 aa12.77□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 SPINT1O43278 529 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 GIPC2Q8TF65 315 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 BCL11AQ9H165 835 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 HIF1AQ16665 826 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00528Q8N1L1 170 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 PARP3Q9Y6F1 533 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 DGKZQ13574 1117 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 NBPF1Q3BBV0 1214 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 TMC1Q8TDI8 760 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 PDE3BQ13370 1112 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G4AP47712 749 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 TMC7Q7Z402 723 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 IFT43Q96FT9 208 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 DMRTB1Q96MA1 342 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 FZD6O60353 706 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 USP5P45974 858 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 C4orf17Q53FE4 359 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRC-212ENST00000491302 UNCXA6NJT0 531 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRC-212ENST00000491302 RGS20O76081 388 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO33Q7Z6M2 555 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRC-212ENST00000491302 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC87Q9NVE4 849 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRC-212ENST00000491302 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRC-212ENST00000491302 BMP2P12643 396 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRC-212ENST00000491302 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRC-212ENST00000491302 TXLNAP40222 546 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRC-212ENST00000491302 FGD1P98174 961 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRC-212ENST00000491302 WDR44Q5JSH3 913 aa12.69□□□□□ -0.38
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