RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490837.1

ILKAP-209, Transcript of ILK associated serine/threonine phosphatase, humanhuman

TSL 4

Gene ILKAP, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILKAP-209ENST00000490837 C10orf71Q711Q0 1435 aa28.86■■■□□ 2.21
ILKAP-209ENST00000490837 NEFMP07197 916 aa28.86■■■□□ 2.21
ILKAP-209ENST00000490837 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.86■■■□□ 2.21
ILKAP-209ENST00000490837 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
ILKAP-209ENST00000490837 GRIN3BO60391 1043 aa28.85■■■□□ 2.21
ILKAP-209ENST00000490837 ZPR1O75312 459 aa28.85■■■□□ 2.21
ILKAP-209ENST00000490837 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.85■■■□□ 2.21
ILKAP-209ENST00000490837 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
ILKAP-209ENST00000490837 NARFQ9UHQ1 456 aa28.84■■■□□ 2.21
ILKAP-209ENST00000490837 DDR1Q08345 913 aa28.83■■■□□ 2.21
ILKAP-209ENST00000490837 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
ILKAP-209ENST00000490837 EIF5P55010 431 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
ILKAP-209ENST00000490837 NFE2L2Q16236 605 aa28.82■■■□□ 2.2
ILKAP-209ENST00000490837 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.82■■■□□ 2.2
ILKAP-209ENST00000490837 TM4SF1P30408 202 aa28.81■■■□□ 2.2
ILKAP-209ENST00000490837 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
ILKAP-209ENST00000490837 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.8■■■□□ 2.2
ILKAP-209ENST00000490837 TGFB2P61812 414 aa28.8■■■□□ 2.2
ILKAP-209ENST00000490837 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.79■■■□□ 2.2
ILKAP-209ENST00000490837 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
ILKAP-209ENST00000490837 CHD4Q14839 1912 aa28.79■■■□□ 2.2
ILKAP-209ENST00000490837 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
ILKAP-209ENST00000490837 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.78■■■□□ 2.2
ILKAP-209ENST00000490837 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.78■■■□□ 2.2
ILKAP-209ENST00000490837 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
ILKAP-209ENST00000490837 A0A087WZG4 1122 aa28.76■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 A1BGP04217 495 aa28.76■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 USP16Q9Y5T5 823 aa28.76■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa28.76■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.75■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 A0A0G2JLW4 131 aa28.74■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 NFIXQ14938 502 aa28.74■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.74■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.73■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 DPEP1P16444 411 aa28.72■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
ILKAP-209ENST00000490837 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa28.7■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 KCNA3P22001 575 aa28.69■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 RIPK4P57078 832 aa28.67■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 SCN7AQ01118 1682 aa28.67■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 CAMTA2O94983 1202 aa28.66■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 SERPINB2P05120 415 aa28.66■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 BCS1LQ9Y276 419 aa28.66■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.65■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.65■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.64■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 NBPF26B4DH59 902 aa28.64■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 BICDL1Q6ZP65 573 aa28.64■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.64■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 NBPF15Q8N660 670 aa28.64■■■□□ 2.18
ILKAP-209ENST00000490837 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.63■■■□□ 2.17
ILKAP-209ENST00000490837 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
ILKAP-209ENST00000490837 CHRNA5P30532 468 aa28.62■■■□□ 2.17
ILKAP-209ENST00000490837 RUNDC1Q96C34 613 aa28.62■■■□□ 2.17
ILKAP-209ENST00000490837 PIM2Q9P1W9 311 aa28.62■■■□□ 2.17
ILKAP-209ENST00000490837 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.61■■■□□ 2.17
ILKAP-209ENST00000490837 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
ILKAP-209ENST00000490837 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
ILKAP-209ENST00000490837 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
ILKAP-209ENST00000490837 ADCY9O60503 1353 aa28.59■■■□□ 2.17
ILKAP-209ENST00000490837 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.59■■■□□ 2.17
ILKAP-209ENST00000490837 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.58■■■□□ 2.17
ILKAP-209ENST00000490837 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.57■■■□□ 2.16
ILKAP-209ENST00000490837 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
ILKAP-209ENST00000490837 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.57■■■□□ 2.16
ILKAP-209ENST00000490837 BCORQ6W2J9 1755 aa28.57■■■□□ 2.16
ILKAP-209ENST00000490837 NEUROD2Q15784 382 aa28.56■■■□□ 2.16
ILKAP-209ENST00000490837 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.56■■■□□ 2.16
ILKAP-209ENST00000490837 SETDB2Q96T68 719 aa28.56■■■□□ 2.16
ILKAP-209ENST00000490837 ATP10DQ9P241 1426 aa28.55■■■□□ 2.16
ILKAP-209ENST00000490837 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.55■■■□□ 2.16
ILKAP-209ENST00000490837 RGL2O15211 777 aa28.54■■■□□ 2.16
ILKAP-209ENST00000490837 PRR5LQ6MZQ0 368 aa28.54■■■□□ 2.16
ILKAP-209ENST00000490837 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa28.54■■■□□ 2.16
ILKAP-209ENST00000490837 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.53■■■□□ 2.16
ILKAP-209ENST00000490837 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
ILKAP-209ENST00000490837 C2CD5Q86YS7 1000 aa28.51■■■□□ 2.15
ILKAP-209ENST00000490837 BRIP1Q9BX63 1249 aa28.51■■■□□ 2.15
ILKAP-209ENST00000490837 CNBD1Q8NA66 436 aa28.5■■■□□ 2.15
ILKAP-209ENST00000490837 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa28.5■■■□□ 2.15
ILKAP-209ENST00000490837 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.49■■■□□ 2.15
ILKAP-209ENST00000490837 ERBB4Q15303 1308 aa28.48■■■□□ 2.15
ILKAP-209ENST00000490837 H0YIN7 160 aa28.48■■■□□ 2.15
ILKAP-209ENST00000490837 CHL1O00533 1208 aa28.48■■■□□ 2.15
ILKAP-209ENST00000490837 PDE6BP35913 854 aa28.47■■■□□ 2.15
ILKAP-209ENST00000490837 HLFQ16534 295 aa28.47■■■□□ 2.15
ILKAP-209ENST00000490837 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms