RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482902.5

SSR4-209, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 2,409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-209ENST00000482902 KCNA6P17658 529 aa21.88■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 USP44Q9H0E7 712 aa21.88■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 MCCP23508 829 aa21.88■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 CHMLP26374 656 aa21.88■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.88■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 STAP2Q9UGK3 403 aa21.88■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.87■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.87■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 TMX3Q96JJ7 454 aa21.87■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.87■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.86■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 C14orf37Q86TY3 774 aa21.86■■□□□ 1.09
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SSR4-209ENST00000482902 PALD1Q9ULE6 856 aa21.86■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.85■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 RNF214Q8ND24 703 aa21.85■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 MCM2P49736 904 aa21.85■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.85■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.85■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.84■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.096e-9■□□□□ 9.1
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SSR4-209ENST00000482902 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.84■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 ANAPC15P60006 121 aa21.83■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 DMTNQ08495 405 aa21.83■■□□□ 1.09
SSR4-209ENST00000482902 SSH3Q8TE77 659 aa21.83■■□□□ 1.09
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SSR4-209ENST00000482902 AOX1Q06278 1338 aa21.82■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.81■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.81■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.81■■□□□ 1.08
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SSR4-209ENST00000482902 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.8■■□□□ 1.08
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SSR4-209ENST00000482902 RAB11FIP3O75154 756 aa21.79■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 TSPY26PQ9H489 355 aa21.79■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.79■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 CACNA1FO60840 1977 aa21.79■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 POLA2Q14181 598 aa21.78■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.78■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 IP6K1Q92551 441 aa21.78■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 LGR6Q9HBX8 967 aa21.78■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 USP54Q70EL1 1684 aa21.78■■□□□ 1.08
SSR4-209ENST00000482902 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
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SSR4-209ENST00000482902 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.77■■□□□ 1.08
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SSR4-209ENST00000482902 BRD1O95696 1058 aa21.76■■□□□ 1.07
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SSR4-209ENST00000482902 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
SSR4-209ENST00000482902 TSC1Q92574 1164 aa21.76■■□□□ 1.07
SSR4-209ENST00000482902 IL17RAQ96F46 866 aa21.76■■□□□ 1.07
SSR4-209ENST00000482902 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SSR4-209ENST00000482902 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.76■■□□□ 1.07
SSR4-209ENST00000482902 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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SSR4-209ENST00000482902 BEND3Q5T5X7 828 aa21.74■■□□□ 1.07
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SSR4-209ENST00000482902 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.74■■□□□ 1.07
SSR4-209ENST00000482902 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SSR4-209ENST00000482902 KCNQ3O43525 872 aa21.74■■□□□ 1.07
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SSR4-209ENST00000482902 PLEKHG5O94827 1062 aa21.7■■□□□ 1.06
SSR4-209ENST00000482902 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SSR4-209ENST00000482902 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SSR4-209ENST00000482902 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SSR4-209ENST00000482902 BTBD11A6QL63 1104 aa21.7■■□□□ 1.06
SSR4-209ENST00000482902 SGSM2O43147 1006 aa21.7■■□□□ 1.06
SSR4-209ENST00000482902 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SSR4-209ENST00000482902 LTN1O94822 1766 aa21.7■■□□□ 1.06
SSR4-209ENST00000482902 CNTROBQ8N137 903 aa21.69■■□□□ 1.06
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