RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482429.1

LTB-212, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 2

Gene LTB, Length 1,388 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-212ENST00000482429 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
LTB-212ENST00000482429 MORC1Q86VD1 984 aa28.11■■■□□ 2.09
LTB-212ENST00000482429 SMC1BQ8NDV3 1235 aa28.11■■■□□ 2.09
LTB-212ENST00000482429 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.1■■■□□ 2.09
LTB-212ENST00000482429 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.09■■■□□ 2.09
LTB-212ENST00000482429 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.09■■■□□ 2.09
LTB-212ENST00000482429 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.09■■■□□ 2.09
LTB-212ENST00000482429 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.09■■■□□ 2.09
LTB-212ENST00000482429 DLEC1Q9Y238 1755 aa28.08■■■□□ 2.09
LTB-212ENST00000482429 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.07■■■□□ 2.08
LTB-212ENST00000482429 IL13P35225 146 aa28.07■■■□□ 2.08
LTB-212ENST00000482429 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
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LTB-212ENST00000482429 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
LTB-212ENST00000482429 LMNB1P20700 586 aa28.06■■■□□ 2.08
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LTB-212ENST00000482429 GLTPD2A6NH11 291 aa28.03■■■□□ 2.08
LTB-212ENST00000482429 COL15A1P39059 1388 aa28.03■■■□□ 2.08
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LTB-212ENST00000482429 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.02■■■□□ 2.08
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LTB-212ENST00000482429 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.99■■■□□ 2.07
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LTB-212ENST00000482429 TIAM2Q8IVF5 1701 aa27.99■■■□□ 2.07
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LTB-212ENST00000482429 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.92■■■□□ 2.06
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LTB-212ENST00000482429 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.81■■■□□ 2.04
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LTB-212ENST00000482429 CHADLQ6NUI6 762 aa27.77■■■□□ 2.04
LTB-212ENST00000482429 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.77■■■□□ 2.04
LTB-212ENST00000482429 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.77■■■□□ 2.04
LTB-212ENST00000482429 TEFQ10587 303 aa27.76■■■□□ 2.03
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LTB-212ENST00000482429 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
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LTB-212ENST00000482429 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.74■■■□□ 2.03
LTB-212ENST00000482429 SOGA3Q5TF21 947 aa27.74■■■□□ 2.03
LTB-212ENST00000482429 STYK1Q6J9G0 422 aa27.74■■■□□ 2.03
LTB-212ENST00000482429 CNBD1Q8NA66 436 aa27.74■■■□□ 2.03
LTB-212ENST00000482429 IL17REQ8NFR9 667 aa27.74■■■□□ 2.03
LTB-212ENST00000482429 SETDB2Q96T68 719 aa27.74■■■□□ 2.03
LTB-212ENST00000482429 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.73■■■□□ 2.03
LTB-212ENST00000482429 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.73■■■□□ 2.03
LTB-212ENST00000482429 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
LTB-212ENST00000482429 CACNA1SQ13698 1873 aa27.73■■■□□ 2.03
LTB-212ENST00000482429 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
LTB-212ENST00000482429 SRGNP10124 158 aa27.73■■■□□ 2.03
LTB-212ENST00000482429 FMNL2Q96PY5 1086 aa27.73■■■□□ 2.03
LTB-212ENST00000482429 CAMTA2O94983 1202 aa27.72■■■□□ 2.03
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