RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 STARD3NLO95772 234 aa25.01■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 DDR1Q08345 913 aa25.01■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 COL15A1P39059 1388 aa25.01■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 A0A0G2JLW4 131 aa25■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 TGFB2P61812 414 aa25■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 FMNL2Q96PY5 1086 aa25■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 C10orf71Q711Q0 1435 aa25■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 PXDNLA1KZ92 1463 aa25■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 NARFQ9UHQ1 456 aa24.99■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 TM4SF1P30408 202 aa24.98■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 DPEP1P16444 411 aa24.97■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 RALBP1Q15311 655 aa24.97■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.96■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.96■■□□□ 1.59
UPP1-211ENST00000482015 NEFMP07197 916 aa24.95■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.94■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 A1BGP04217 495 aa24.94■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 NFIXQ14938 502 aa24.94■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.93■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 BCS1LQ9Y276 419 aa24.93■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.92■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 USP16Q9Y5T5 823 aa24.92■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 A0A087WZG4 1122 aa24.91■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 KCNA3P22001 575 aa24.91■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.91■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.9■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 NFE2L2Q16236 605 aa24.89■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.89■■□□□ 1.58
UPP1-211ENST00000482015 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
UPP1-211ENST00000482015 CHRNA5P30532 468 aa24.88■■□□□ 1.57
UPP1-211ENST00000482015 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
UPP1-211ENST00000482015 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.87■■□□□ 1.57
UPP1-211ENST00000482015 SERPINB2P05120 415 aa24.87■■□□□ 1.57
UPP1-211ENST00000482015 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
UPP1-211ENST00000482015 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
UPP1-211ENST00000482015 PIM2Q9P1W9 311 aa24.86■■□□□ 1.57
UPP1-211ENST00000482015 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.85■■□□□ 1.57
UPP1-211ENST00000482015 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
UPP1-211ENST00000482015 ATP10DQ9P241 1426 aa24.85■■□□□ 1.57
UPP1-211ENST00000482015 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.84■■□□□ 1.57
UPP1-211ENST00000482015 CAMTA2O94983 1202 aa24.82■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 ADCY9O60503 1353 aa24.81■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 NBPF26B4DH59 902 aa24.8■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 NBPF15Q8N660 670 aa24.8■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.8■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 RIPK4P57078 832 aa24.79■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.79■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 C1QTNF8P60827 252 aa24.78■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.78■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.78■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.78■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 SCN7AQ01118 1682 aa24.77■■□□□ 1.56
UPP1-211ENST00000482015 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.76■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 SETDB2Q96T68 719 aa24.76■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.75■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 H0YIN7 160 aa24.73■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 NEUROD2Q15784 382 aa24.73■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.72■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.72■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.72■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.72■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 NPHP1O15259 732 aa24.71■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.71■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 NGEFQ8N5V2 710 aa24.71■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 CNBD1Q8NA66 436 aa24.71■■□□□ 1.55
UPP1-211ENST00000482015 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.7■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 TTLL6Q8N841 843 aa24.7■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 RUNDC1Q96C34 613 aa24.7■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.7■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 PDE6BP35913 854 aa24.69■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.69■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.69■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 BCORQ6W2J9 1755 aa24.68■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 HLFQ16534 295 aa24.68■■□□□ 1.54
UPP1-211ENST00000482015 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms