RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482013.1

GGPS1-205, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene GGPS1, Length 470 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-205ENST00000482013 DCTPP1Q9H773 170 aa14.65□□□□□ -0.06
GGPS1-205ENST00000482013 SLIT2O94813 1529 aa14.65□□□□□ -0.06
GGPS1-205ENST00000482013 CEP85Q6P2H3 762 aa14.64□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.64□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 PDIA6Q15084 440 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 BEND3Q5T5X7 828 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 BARGINQ6ZT62 677 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 SKAP1Q86WV1 359 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 CERKQ8TCT0 537 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 TNS2Q63HR2 1409 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 GLI3P10071 1580 aa14.63□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 ADCY9O60503 1353 aa14.62□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 ITGB4P16144 1822 aa14.62□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 ADAMTS2O95450 1211 aa14.62□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 USP44Q9H0E7 712 aa14.62□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 USP35Q9P2H5 1018 aa14.62□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.62□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.62□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 ATP8B2P98198 1209 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.61□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 PROSER3Q2NL68 480 aa14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 C8orf34Q49A92 452 aa14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 LINS1Q8NG48 757 aa14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 USP16Q9Y5T5 823 aa14.6□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.59□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.59□□□□□ -0.07
GGPS1-205ENST00000482013 ANXA1P04083 346 aa14.58□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.58□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.58□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 BCL9O00512 1426 aa14.58□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 UTYO14607 1347 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 VPS72Q15906 364 aa14.56□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 DDB1Q16531 1140 aa14.56□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.56□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 COPS6Q7L5N1 327 aa14.56□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.56□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 PIGBQ92521 554 aa14.56□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 LNPKQ9C0E8 428 aa14.56□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 MTX1Q13505 466 aa14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 POLA2Q14181 598 aa14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 SSH3Q8TE77 659 aa14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 MYL6BP14649 208 aa14.54□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 ATG3Q9NT62 314 aa14.54□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.54□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.53□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 RAB11FIP3O75154 756 aa14.53□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.53□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.53□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 NGLY1Q96IV0 654 aa14.53□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.52□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 COL15A1P39059 1388 aa14.52□□□□□ -0.08
GGPS1-205ENST00000482013 GRM8O00222 908 aa14.52□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 STARD3NLO95772 234 aa14.52□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.52□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.51□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 NBPF26B4DH59 902 aa14.51□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 NBPF14Q5TI25 921 aa14.51□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 NBPF15Q8N660 670 aa14.51□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.51□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.5□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 IGKV5-2P06315 115 aa14.5□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 GCKRQ14397 625 aa14.5□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.5□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.5□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.5□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.5□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
GGPS1-205ENST00000482013 A1BGP04217 495 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms