RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
C9orf3-215ENST00000478473 COL15A1P39059 1388 aa31.1■■■□□ 2.57
C9orf3-215ENST00000478473 GRIN3BO60391 1043 aa31.1■■■□□ 2.57
C9orf3-215ENST00000478473 NEFMP07197 916 aa31.1■■■□□ 2.57
C9orf3-215ENST00000478473 EIF5P55010 431 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
C9orf3-215ENST00000478473 FKBP8Q14318 412 aa31.1■■■□□ 2.57
C9orf3-215ENST00000478473 NARFQ9UHQ1 456 aa31.1■■■□□ 2.57
C9orf3-215ENST00000478473 KCNQ3O43525 872 aa31.09■■■□□ 2.57
C9orf3-215ENST00000478473 TM4SF1P30408 202 aa31.08■■■□□ 2.57
C9orf3-215ENST00000478473 NFE2L2Q16236 605 aa31.08■■■□□ 2.57
C9orf3-215ENST00000478473 TGFB2P61812 414 aa31.07■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 DCTN1Q14203 1278 aa31.07■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 PARP3Q9Y6F1 533 aa31.07■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa31.06■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 DLG5Q8TDM6 1919 aa31.05■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 ZPR1O75312 459 aa31.05■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 PXDNLA1KZ92 1463 aa31.05■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 DDR1Q08345 913 aa31.04■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 USPL1Q5W0Q7 1092 aa31.04■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 BCL2L12Q9HB09 334 aa31.03■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 A0A087WZG4 1122 aa31.02■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 CANXP27824 592 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
C9orf3-215ENST00000478473 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
C9orf3-215ENST00000478473 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa31■■■□□ 2.55
C9orf3-215ENST00000478473 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
C9orf3-215ENST00000478473 USP16Q9Y5T5 823 aa30.99■■■□□ 2.55
C9orf3-215ENST00000478473 A1BGP04217 495 aa30.97■■■□□ 2.55
C9orf3-215ENST00000478473 NFIXQ14938 502 aa30.97■■■□□ 2.55
C9orf3-215ENST00000478473 NRXN2Q9P2S2 1712 aa30.96■■■□□ 2.55
C9orf3-215ENST00000478473 KDM3BQ7LBC6 1761 aa30.95■■■□□ 2.55
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
C9orf3-215ENST00000478473 KCNA3P22001 575 aa30.94■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa30.93■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 SCN7AQ01118 1682 aa30.93■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 A0A0G2JLW4 131 aa30.92■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 DPEP1P16444 411 aa30.92■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 TMPOP42166 694 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 MIS18AQ9NYP9 233 aa30.91■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 RGL2O15211 777 aa30.9■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 RIPK4P57078 832 aa30.9■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 BABAM1Q9NWV8 329 aa30.9■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 CAMTA2O94983 1202 aa30.89■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
C9orf3-215ENST00000478473 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 SERPINB2P05120 415 aa30.88■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 LMOD3Q0VAK6 560 aa30.88■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa30.88■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 NBPF26B4DH59 902 aa30.87■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 NBPF15Q8N660 670 aa30.87■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 RUNDC1Q96C34 613 aa30.87■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 ADAMTS8Q9UP79 889 aa30.87■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP30.86■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 LAMB4A4D0S4 1761 aa30.86■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 TBC1D9BQ66K14 1250 aa30.85■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 BCORQ6W2J9 1755 aa30.84■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 CLEC4GQ6UXB4 293 aa30.84■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 PIM2Q9P1W9 311 aa30.84■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 ADCY9O60503 1353 aa30.83■■■□□ 2.53
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
C9orf3-215ENST00000478473 WWC3Q9ULE0 1092 aa30.81■■■□□ 2.52
C9orf3-215ENST00000478473 BCS1LQ9Y276 419 aa30.81■■■□□ 2.52
C9orf3-215ENST00000478473 CARMIL3Q8ND23 1372 aa30.8■■■□□ 2.52
C9orf3-215ENST00000478473 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC146Q8IYE0 955 aa30.8■■■□□ 2.52
C9orf3-215ENST00000478473 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa30.8■■■□□ 2.52
C9orf3-215ENST00000478473 TRIM35Q9UPQ4 493 aa30.79■■■□□ 2.52
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
C9orf3-215ENST00000478473 CHRNA5P30532 468 aa30.78■■■□□ 2.52
C9orf3-215ENST00000478473 TSPYL4Q9UJ04 414 aa30.78■■■□□ 2.52
C9orf3-215ENST00000478473 ERBB4Q15303 1308 aa30.77■■■□□ 2.52
C9orf3-215ENST00000478473 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
C9orf3-215ENST00000478473 BICDL1Q6ZP65 573 aa30.77■■■□□ 2.52
C9orf3-215ENST00000478473 SETDB2Q96T68 719 aa30.76■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa30.76■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 CHL1O00533 1208 aa30.75■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 PRR5LQ6MZQ0 368 aa30.75■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 BRIP1Q9BX63 1249 aa30.75■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF652Q9Y2D9 606 aa30.75■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 DLEC1Q9Y238 1755 aa30.74■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 ATP10DQ9P241 1426 aa30.72■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 ERVV-1B6SEH8 477 aa30.71■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa30.71■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 NEUROD2Q15784 382 aa30.7■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 H0YIN7 160 aa30.69■■■□□ 2.5
C9orf3-215ENST00000478473 LRP10Q7Z4F1 713 aa30.69■■■□□ 2.5
C9orf3-215ENST00000478473 PDE6BP35913 854 aa30.68■■■□□ 2.5
C9orf3-215ENST00000478473 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.3 ms