RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
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C9orf3-215ENST00000478473 NEFMP07197 916 aa31.1■■■□□ 2.57
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C9orf3-215ENST00000478473 NARFQ9UHQ1 456 aa31.1■■■□□ 2.57
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C9orf3-215ENST00000478473 DCTN1Q14203 1278 aa31.07■■■□□ 2.56
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C9orf3-215ENST00000478473 ZPR1O75312 459 aa31.05■■■□□ 2.56
C9orf3-215ENST00000478473 PXDNLA1KZ92 1463 aa31.05■■■□□ 2.56
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C9orf3-215ENST00000478473 BCL2L12Q9HB09 334 aa31.03■■■□□ 2.56
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C9orf3-215ENST00000478473 NFIXQ14938 502 aa30.97■■■□□ 2.55
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C9orf3-215ENST00000478473 ERVV-1B6SEH8 477 aa30.71■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa30.71■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 NEUROD2Q15784 382 aa30.7■■■□□ 2.51
C9orf3-215ENST00000478473 H0YIN7 160 aa30.69■■■□□ 2.5
C9orf3-215ENST00000478473 LRP10Q7Z4F1 713 aa30.69■■■□□ 2.5
C9orf3-215ENST00000478473 PDE6BP35913 854 aa30.68■■■□□ 2.5
C9orf3-215ENST00000478473 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa30.68■■■□□ 2.5
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