RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 PDE3AQ14432 1141 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 C5P01031 1676 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 MYL6BP14649 208 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 POTEAQ6S8J7 498 aa23.05■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.05■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 FLIIQ13045 1269 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 PDIA6Q15084 440 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 HOXB7P09629 217 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 KCNQ4P56696 695 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.03■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 A1BGP04217 495 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
ATG4B-217ENST00000475693 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 RGS12O14924 1447 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 PAPPAQ13219 1627 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 PPP4R2Q9NY27 417 aa23■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGAP45Q92619 1136 aa23■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 NBPF26B4DH59 902 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 NBPF14Q5TI25 921 aa22.99■■□□□ 1.27
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ATG4B-217ENST00000475693 NBPF15Q8N660 670 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 RXRBP28702 533 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.98■■□□□ 1.27
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ATG4B-217ENST00000475693 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 ABCC4O15439 1325 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 PTPRCP08575 1304 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4B-217ENST00000475693 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.95■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 COPS6Q7L5N1 327 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 PALLDQ8WX93 1383 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 ATP6V1AP38606 617 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.93■■□□□ 1.26
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ATG4B-217ENST00000475693 ITPK1Q13572 414 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 TRIM37O94972 964 aa22.92■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 HYPKQ9NX55 129 aa22.92■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 MS4A1P11836 297 aa22.92■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 ADCY9O60503 1353 aa22.91■■□□□ 1.26
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ATG4B-217ENST00000475693 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.9■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.9■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 SMIM5Q71RC9 77 aa22.9■■□□□ 1.26
ATG4B-217ENST00000475693 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.9■■□□□ 1.26
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ATG4B-217ENST00000475693 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.89■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 STARD3NLO95772 234 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 MEIS3Q99687 375 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 CACNA1FO60840 1977 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 BTAF1O14981 1849 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 SBF2Q86WG5 1849 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 IGHDP01880 384 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 KSR2Q6VAB6 950 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.86■■□□□ 1.25
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ATG4B-217ENST00000475693 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.85■■□□□ 1.25
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ATG4B-217ENST00000475693 NHSQ6T4R5 1651 aa22.83■■□□□ 1.25
ATG4B-217ENST00000475693 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-217ENST00000475693 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-217ENST00000475693 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-217ENST00000475693 MYD88Q99836 296 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-217ENST00000475693 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-217ENST00000475693 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-217ENST00000475693 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.8■■□□□ 1.24
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