RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468747.5

FAM107B-211, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM107B, Length 2,633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM107B-211ENST00000468747 CCDC39Q9UFE4 941 aa27.16■■□□□ 1.94
FAM107B-211ENST00000468747 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.16■■□□□ 1.94
FAM107B-211ENST00000468747 GDPD2Q9HCC8 539 aa27.16■■□□□ 1.94
FAM107B-211ENST00000468747 HMMRO75330 724 aa27.15■■□□□ 1.94
FAM107B-211ENST00000468747 CUL4AQ13619 759 aa27.14■■□□□ 1.94
FAM107B-211ENST00000468747 NFAT5O94916 1531 aa27.14■■□□□ 1.94
FAM107B-211ENST00000468747 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 STK31Q9BXU1 1019 aa27.13■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 MCM5P33992 734 aa27.13■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 MPNDQ8N594 471 aa27.12■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.12■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.12■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 LRRC37A3O60309 1634 aa27.12■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.11■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 ARID3AQ99856 593 aa27.11■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 TSPY26PQ9H489 355 aa27.11■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.1■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.1■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 LTN1O94822 1766 aa27.1■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 FLIIQ13045 1269 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 RILPL2Q969X0 211 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 CCT4P50991 539 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 CHMLP26374 656 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 GCP02774 474 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 PTMAP06454 111 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 MCM2P49736 904 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.93
FAM107B-211ENST00000468747 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 MX1P20591 662 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 LGR6Q9HBX8 967 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 IL25Q9H293 177 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 GNAI2P04899 355 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 SASS6Q6UVJ0 657 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 USP48Q86UV5 1035 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 MCCP23508 829 aa27.04■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.04■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.04■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 DYNC1I1O14576 645 aa27.03■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.03■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 MAP7D2Q96T17 732 aa27.03■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 ANAPC15P60006 121 aa27.02■■□□□ 1.92
FAM107B-211ENST00000468747 KIAA2012Q0VF49 1180 aa27.01■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.01■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 USP25Q9UHP3 1055 aa26.99■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 KCNQ3O43525 872 aa26.99■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.98■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.98■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.98■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 TSC1Q92574 1164 aa26.97■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 ATP8B2P98198 1209 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 CNPY2Q9Y2B0 182 aa26.96■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
FAM107B-211ENST00000468747 STAP2Q9UGK3 403 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM107B-211ENST00000468747 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
FAM107B-211ENST00000468747 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM107B-211ENST00000468747 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
FAM107B-211ENST00000468747 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
FAM107B-211ENST00000468747 SLIT3O75094 1523 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM107B-211ENST00000468747 PHF14O94880 888 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM107B-211ENST00000468747 GNAI3P08754 354 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM107B-211ENST00000468747 IL17RAQ96F46 866 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM107B-211ENST00000468747 TCHHQ07283 1943 aa26.93■■□□□ 1.9
FAM107B-211ENST00000468747 PRDM4Q9UKN5 801 aa26.93■■□□□ 1.9
FAM107B-211ENST00000468747 DTNBO60941 627 aa26.93■■□□□ 1.9
FAM107B-211ENST00000468747 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
FAM107B-211ENST00000468747 TEFQ10587 303 aa26.93■■□□□ 1.9
FAM107B-211ENST00000468747 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms