RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.23■■□□□ 1.31
NME4-210ENST00000468031 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.23■■□□□ 1.31
NME4-210ENST00000468031 ALDH1L1O75891 902 aa23.22■■□□□ 1.31
NME4-210ENST00000468031 KSR2Q6VAB6 950 aa23.22■■□□□ 1.31
NME4-210ENST00000468031 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
NME4-210ENST00000468031 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
NME4-210ENST00000468031 APBB1O00213 710 aa23.22■■□□□ 1.31
NME4-210ENST00000468031 ANXA1P04083 346 aa23.22■■□□□ 1.31
NME4-210ENST00000468031 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.22■■□□□ 1.31
NME4-210ENST00000468031 C5P01031 1676 aa23.21■■□□□ 1.31
NME4-210ENST00000468031 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.21■■□□□ 1.31
NME4-210ENST00000468031 POLA2Q14181 598 aa23.21■■□□□ 1.31
NME4-210ENST00000468031 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.21■■□□□ 1.31
NME4-210ENST00000468031 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.19■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 PROSER3Q2NL68 480 aa23.19■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 PDE1AP54750 535 aa23.19■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.19■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 SDSP20132 328 aa23.18■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 PDIA6Q15084 440 aa23.18■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 RAB11FIP3O75154 756 aa23.17■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.17■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 SLC39A6Q13433 755 aa23.17■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.17■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 SNX21Q969T3 373 aa23.17■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 MTX1Q13505 466 aa23.16■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 CASC1Q6TDU7 716 aa23.16■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.16■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.16■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.16■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 NFKBIBQ15653 356 aa23.15■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.15■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.15■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 LINS1Q8NG48 757 aa23.15■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.15■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 STAP2Q9UGK3 403 aa23.15■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 AOX1Q06278 1338 aa23.14■■□□□ 1.3
NME4-210ENST00000468031 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.14■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.14■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 MX1P20591 662 aa23.13■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 HSCBQ8IWL3 235 aa23.13■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 KIF2CQ99661 725 aa23.13■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 CABP4P57796 275 aa23.13■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 GLI3P10071 1580 aa23.13■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 UTYO14607 1347 aa23.12■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.12■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 SRGAP3O43295 1099 aa23.12■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 BCL11AQ9H165 835 aa23.12■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 IL2RBP14784 551 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 USP26Q9BXU7 913 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-210ENST00000468031 GRM8O00222 908 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 PAPPAQ13219 1627 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 REC8O95072 547 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 ERBB4Q15303 1308 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 USP16Q9Y5T5 823 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 ERC2O15083 957 aa23.05■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 MYL6BP14649 208 aa23.05■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 COPS6Q7L5N1 327 aa23.05■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 IGKV5-2P06315 115 aa23.04■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.03■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 EVA1CP58658 441 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 RABEP1Q15276 862 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-210ENST00000468031 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-210ENST00000468031 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NME4-210ENST00000468031 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NME4-210ENST00000468031 STRN4Q9NRL3 753 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-210ENST00000468031 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NME4-210ENST00000468031 TNS2Q63HR2 1409 aa23■■□□□ 1.27
NME4-210ENST00000468031 KAZALD1Q96I82 304 aa23■■□□□ 1.27
NME4-210ENST00000468031 SUCLG2Q96I99 432 aa23■■□□□ 1.27
NME4-210ENST00000468031 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23■■□□□ 1.27
NME4-210ENST00000468031 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NME4-210ENST00000468031 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23■■□□□ 1.27
NME4-210ENST00000468031 DEKP35659 375 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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