RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CYP27B1	O15528	508 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PHF14	O94880	888 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PIGB	Q92521	554 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADCY9	O60503	1353 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATP6V1A	P38606	617 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C4B	P0C0L5	1744 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GNPAT	O15228	680 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TOMM70	O94826	608 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PYGB	P11216	843 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PDE4A	P27815	886 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BACH2	Q9BYV9	841 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FBLN1	P23142	703 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RFC4	P35249	363 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NCAPD2	Q15021	1401 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MMP10	P09238	476 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	POTEI	P0CG38	1075 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PHKG2	P15735	406 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DCAF5	Q96JK2	942 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CEP350	Q5VT06	3117 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ITGB4	P16144	1822 aa		11.59	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FSTL1	Q12841	308 aa		11.59	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		11.59	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		11.59	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EYA1	Q99502	592 aa		11.59	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BCS1L	Q9Y276	419 aa		11.59	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		11.59	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		11.59	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.59	□□□□□ -0.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIF3C	O14782	793 aa		11.58	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RPS6KA4	O75676	772 aa		11.58	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FCHSD2	O94868	740 aa		11.58	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CLCN6	P51797	869 aa		11.58	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		11.58	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PIM2	Q9P1W9	311 aa		11.58	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		11.58	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		11.58	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CABP4	P57796	275 aa		11.57	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATG3	Q9NT62	314 aa		11.57	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC184	Q52MB2	194 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	POLK	Q9UBT6	870 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A0A0G2JLW4	131 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MTHFS	P49914	203 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ITPK1	Q13572	414 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZPR1	O75312	459 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GYS1	P13807	737 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BECN1	Q14457	450 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DPEP1	P16444	411 aa		11.52	□□□□□ -0.57
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KDR	P35968	1356 aa		11.52	□□□□□ -0.57
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		11.52	□□□□□ -0.57
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		11.52	□□□□□ -0.57
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM161A	Q3B820	660 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		11.51	□□□□□ -0.57

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