RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462166.1

TPRKB-204, Transcript of TP53RK binding protein, human

TSL 3

Gene TPRKB, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPRKB-204	ENST00000462166	ANP32C	O43423	234 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TPRKB-204	ENST00000462166	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TPRKB-204	ENST00000462166	MRC1	P22897	1456 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TPRKB-204	ENST00000462166	PSEN1	P49768	467 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	NEFM	P07197	916 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	SIK1	P57059	783 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	CASZ1	Q86V15	1759 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	MCM10	Q7L590	875 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	C4B	P0C0L5	1744 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	ATP6V1A	P38606	617 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	ITPK1	Q13572	414 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	TEF	Q10587	303 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	TJP1	Q07157	1748 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	NFE2L2	Q16236	605 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	SMIM5	Q71RC9	77 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.83	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		13.83	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.19
TPRKB-204	ENST00000462166	ZBTB7A	O95365	584 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	PHF12	Q96QT6	1004 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	AK7	Q96M32	723 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	LRP5	O75197	1615 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	KCNQ3	O43525	872 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	PHF14	O94880	888 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	BTBD11	A6QL63	1104 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	RIPK4	P57078	832 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	GNPAT	O15228	680 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	SPON1	Q9HCB6	807 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TPRKB-204	ENST00000462166	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	MSL1	Q68DK7	614 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	APAF1	O14727	1248 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	MTFR1L	Q9H019	292 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	C4A	P0C0L4	1744 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	SSFA2	P28290	1259 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	PTGER2	P43116	358 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TPRKB-204	ENST00000462166	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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