RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 ERBB4Q15303 1308 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 KCPQ6ZWJ8 1503 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 BCL9O00512 1426 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 ATRNO75882 1429 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 CCT4P50991 539 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 SLC39A6Q13433 755 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 HYPKQ9NX55 129 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 VSIG10Q8N0Z9 540 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP16.29■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 CHPF2Q9P2E5 772 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 KDM2BQ8NHM5 1336 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 DDX58O95786 925 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 G2E3Q7L622 706 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 NECTIN2Q92692 538 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-203ENST00000460759 ATP10DQ9P241 1426 aa16.27■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 PIGBQ92521 554 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 ZNF831Q5JPB2 1677 aa16.24■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 ATG3Q9NT62 314 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 NHSQ6T4R5 1651 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 SLC4A10Q6U841 1118 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 KSR2Q6VAB6 950 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 DNAAF4Q8WXU2 420 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 A0A0G2JS52 829 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 GNAI3P08754 354 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 MYT1Q01538 1121 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 PDIA6Q15084 440 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 USP16Q9Y5T5 823 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-203ENST00000460759 EP400Q96L91 3159 aa16.2■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 F6X3S4 739 aa16.2■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 STARD3NLO95772 234 aa16.2■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa16.2■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 HDAC5Q9UQL6 1122 aa16.2■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 ADCY9O60503 1353 aa16.2■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 TJP1Q07157 1748 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 PI4KAP2A4QPH2 592 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 ALDH1L1O75891 902 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 PROSER3Q2NL68 480 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 LRP10Q7Z4F1 713 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 ANXA1P04083 346 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 NEXNQ0ZGT2 675 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 IGHDP01880 384 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 GNAI2P04899 355 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 MYL6BP14649 208 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 BEND3Q5T5X7 828 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 RIC3Q7Z5B4 369 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 LINS1Q8NG48 757 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 XAGE3Q8WTP9 111 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 NUP188Q5SRE5 1749 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 PALLDQ8WX93 1383 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 RREB1Q92766 1687 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 HMMRO75330 724 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 COPS6Q7L5N1 327 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 PLBD2Q8NHP8 589 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 GCC1Q96CN9 775 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 ACSBG1Q96GR2 724 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 MEIS3Q99687 375 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-203ENST00000460759 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-203ENST00000460759 DNAJC10Q8IXB1 793 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-203ENST00000460759 SMC5Q8IY18 1101 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-203ENST00000460759 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-203ENST00000460759 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-203ENST00000460759 BTAF1O14981 1849 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-203ENST00000460759 SBF2Q86WG5 1849 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-203ENST00000460759 NBPF26B4DH59 902 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms