RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP1-204ENST00000459646 CEP350Q5VT06 3117 aa11.46□□□□□ -0.57
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SH3BP1-204ENST00000459646 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
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SH3BP1-204ENST00000459646 NARFQ9UHQ1 456 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP1-204ENST00000459646 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.46□□□□□ -0.58
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SH3BP1-204ENST00000459646 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF790Q6PG37 636 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 PHACTR3Q96KR7 559 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa11.43□□□□□ -0.58
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SH3BP1-204ENST00000459646 PPP2R1AP30153 589 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
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SH3BP1-204ENST00000459646 RNF181Q9P0P0 153 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 KCPQ6ZWJ8 1503 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 UBR2Q8IWV8 1755 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 ADCY9O60503 1353 aa11.42□□□□□ -0.58
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SH3BP1-204ENST00000459646 A1BGP04217 495 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 C2CD5Q86YS7 1000 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 MRC1P22897 1456 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 SBF1O95248 1867 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 HEG1Q9ULI3 1381 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 CACNA1SQ13698 1873 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 KCNQ3O43525 872 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 MCM10Q7L590 875 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP11.41□□□□□ -0.58
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SH3BP1-204ENST00000459646 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.4□□□□□ -0.58
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SH3BP1-204ENST00000459646 TTLL6Q8N841 843 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-204ENST00000459646 SETDB2Q96T68 719 aa11.39□□□□□ -0.59
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SH3BP1-204ENST00000459646 MIS18AQ9NYP9 233 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP1-204ENST00000459646 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.38□□□□□ -0.59
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SH3BP1-204ENST00000459646 FAM177BA6PVY3 158 aa11.37□□□□□ -0.59
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SH3BP1-204ENST00000459646 DLEC1Q9Y238 1755 aa11.36□□□□□ -0.59
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SH3BP1-204ENST00000459646 C21orf2O43822 256 aa11.35□□□□□ -0.59
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SH3BP1-204ENST00000459646 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa11.35□□□□□ -0.59
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SH3BP1-204ENST00000459646 CAMTA2O94983 1202 aa11.34□□□□□ -0.59
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SH3BP1-204ENST00000459646 APLP1P51693 650 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-204ENST00000459646 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-204ENST00000459646 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF652Q9Y2D9 606 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-204ENST00000459646 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-204ENST00000459646 SCN7AQ01118 1682 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
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