RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SH3BP2-204ENST00000452765 ABCC4O15439 1325 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SH3BP2-204ENST00000452765 ATRNO75882 1429 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2-204ENST00000452765 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2-204ENST00000452765 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2-204ENST00000452765 CACNA1FO60840 1977 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2-204ENST00000452765 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2-204ENST00000452765 BCL9O00512 1426 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2-204ENST00000452765 MYL6BP14649 208 aa26.58■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 PDIA6Q15084 440 aa26.58■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 MS4A1P11836 297 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 PAPPAQ13219 1627 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 PTPRCP08575 1304 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 A1BGP04217 495 aa26.51■■□□□ 1.84
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 SKAP1Q86WV1 359 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 IGHDP01880 384 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 FBXO41Q8TF61 875 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 NBPF26B4DH59 902 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 NBPF14Q5TI25 921 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 NBPF15Q8N660 670 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 ADCY9O60503 1353 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 COPS6Q7L5N1 327 aa26.45■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 HYPKQ9NX55 129 aa26.45■■□□□ 1.83
SH3BP2-204ENST00000452765 KCNQ4P56696 695 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-204ENST00000452765 MEIS3Q99687 375 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-204ENST00000452765 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-204ENST00000452765 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-204ENST00000452765 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-204ENST00000452765 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-204ENST00000452765 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-204ENST00000452765 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-204ENST00000452765 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-204ENST00000452765 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 KSR2Q6VAB6 950 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 PALLDQ8WX93 1383 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP6V1AP38606 617 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 BEND3Q5T5X7 828 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 SIK1P57059 783 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 ITPK1Q13572 414 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 USP44Q9H0E7 712 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 SBF2Q86WG5 1849 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 TJP1Q07157 1748 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 STARD3NLO95772 234 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 ARXQ96QS3 562 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 BTAF1O14981 1849 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 AAMPQ13685 434 aa26.33■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 POTEAQ6S8J7 498 aa26.33■■□□□ 1.81
SH3BP2-204ENST00000452765 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2-204ENST00000452765 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2-204ENST00000452765 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-204ENST00000452765 MYD88Q99836 296 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-204ENST00000452765 IGKV5-2P06315 115 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-204ENST00000452765 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-204ENST00000452765 ERBB4Q15303 1308 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-204ENST00000452765 SMIM5Q71RC9 77 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-204ENST00000452765 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-204ENST00000452765 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-204ENST00000452765 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-204ENST00000452765 RXRBP28702 533 aa26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms