RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445077.1

RBMS3-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 3, human

TSL 3

Gene RBMS3, Length 448 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS3-208	ENST00000445077	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	SMTNL1	A8MU46	457 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	CCP110	O43303	1012 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	RILPL2	Q969X0	211 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	F13A1	P00488	732 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	TPM1	P09493	284 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	HMOX1	P09601	288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	CDC25B	P30305	580 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	MAP3K11	Q16584	847 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	RNF214	Q8ND24	703 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	CFAP45	Q9UL16	551 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	ATP10D	Q9P241	1426 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	HOXB7	P09629	217 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	TPM4	P67936	248 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	KRT32	Q14532	448 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	CHADL	Q6NUI6	762 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	DRC7	Q8IY82	874 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	ANKRD7	Q92527	254 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	SGSM2	O43147	1006 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	GSDMD	P57764	484 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	TUBB4B	P68371	445 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	POTEH	Q6S545	545 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	MSH6	P52701	1360 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	RAD50	Q92878	1312 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	SYT1	P21579	422 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	SSH3	Q8TE77	659 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	MEIS3	Q99687	375 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	MAP3K5	Q99683	1374 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	PKP1	Q13835	747 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	TEX35	Q5T0J7	233 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	KCNB2	Q92953	911 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	EVI5L	Q96CN4	794 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	TNMD	Q9H2S6	317 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	KCND1	Q9NSA2	647 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	ALK	Q9UM73	1620 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	ATP8B1	O43520	1251 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	RGS22	Q8NE09	1264 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	MYO1B	O43795	1136 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RBMS3-208	ENST00000445077	FLII	Q13045	1269 aa		10.36	□□□□□ -0.75

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