RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443090.1

GCSHP5-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 5, humanhuman

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Gene GCSHP5, Length 522 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP5-201ENST00000443090 COL15A1P39059 1388 aa26.92■■□□□ 1.9
GCSHP5-201ENST00000443090 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.91■■□□□ 1.9
GCSHP5-201ENST00000443090 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
GCSHP5-201ENST00000443090 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
GCSHP5-201ENST00000443090 NARFQ9UHQ1 456 aa26.91■■□□□ 1.9
GCSHP5-201ENST00000443090 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.91■■□□□ 1.9
GCSHP5-201ENST00000443090 CHRNA5P30532 468 aa26.89■■□□□ 1.9
GCSHP5-201ENST00000443090 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.89■■□□□ 1.9
GCSHP5-201ENST00000443090 NFIXQ14938 502 aa26.88■■□□□ 1.89
GCSHP5-201ENST00000443090 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.87■■□□□ 1.89
GCSHP5-201ENST00000443090 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.87■■□□□ 1.89
GCSHP5-201ENST00000443090 TOMM70O94826 608 aa26.86■■□□□ 1.89
GCSHP5-201ENST00000443090 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
GCSHP5-201ENST00000443090 SBF1O95248 1867 aa26.85■■□□□ 1.89
GCSHP5-201ENST00000443090 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.84■■□□□ 1.89
GCSHP5-201ENST00000443090 IL17REQ8NFR9 667 aa26.82■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.82■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.81■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.8■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 STARD3NLO95772 234 aa26.8■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 SERPINB2P05120 415 aa26.8■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 APLP1P51693 650 aa26.8■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 RNF181Q9P0P0 153 aa26.8■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.8■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 SCN7AQ01118 1682 aa26.79■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 TEFQ10587 303 aa26.79■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF790Q6PG37 636 aa26.79■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.78■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.77■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
GCSHP5-201ENST00000443090 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.76■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 A0A087WZG4 1122 aa26.76■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 IFFO2Q5TF58 517 aa26.76■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 RASSF7Q02833 373 aa26.74■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.74■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.73■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.73■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.72■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.72■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TTLL6Q8N841 843 aa26.72■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 WDR90Q96KV7 1748 aa26.72■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.71■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.71■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.71■■□□□ 1.87
GCSHP5-201ENST00000443090 H0YIN7 160 aa26.7■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PRKAR2BP31323 418 aa26.7■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PRELPP51888 382 aa26.7■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 LMNB1P20700 586 aa26.69■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 FSTL1Q12841 308 aa26.69■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 CFAP53Q96M91 514 aa26.69■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 RRAGCQ9HB90 399 aa26.68■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.68■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 BCORQ6W2J9 1755 aa26.68■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.68■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 KCNQ3O43525 872 aa26.67■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 A1BGP04217 495 aa26.67■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.66■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 BTBD11A6QL63 1104 aa26.66■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 NFKBIEO00221 500 aa26.66■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.66■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.66■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 CAMTA2O94983 1202 aa26.65■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.65■■□□□ 1.86
GCSHP5-201ENST00000443090 PDE6BP35913 854 aa26.63■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 NUDCQ9Y266 331 aa26.63■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 GLTPD2A6NH11 291 aa26.62■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 PPP2R1AP30153 589 aa26.62■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.62■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.61■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 USP16Q9Y5T5 823 aa26.61■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 SETDB2Q96T68 719 aa26.6■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 HTRA3P83110 453 aa26.59■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 CNBD1Q8NA66 436 aa26.59■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.59■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.58■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 MCM10Q7L590 875 aa26.58■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.58■■□□□ 1.85
GCSHP5-201ENST00000443090 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 KLRG1Q96E93 195 aa26.57■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 SLX4Q8IY92 1834 aa26.56■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 C21orf2O43822 256 aa26.56■■□□□ 1.84
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