RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 DAAM2Q86T65 1068 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SCP2P22307 547 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ATICP31939 592 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 MXRA7P84157 204 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 OGFOD1Q8N543 542 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ERO1AQ96HE7 468 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 VCXQ9H320 206 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP25P42331 645 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 LIG3P49916 1009 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 BLVRAP53004 296 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 LRRD1A4D1F6 860 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 POTEB2H3BUK9 544 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SPDL1Q96EA4 605 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 FSD2A1L4K1 749 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 NEMFO60524 1076 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 MORC1Q86VD1 984 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 VCX3BQ9H321 246 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 UVSSAQ2YD98 709 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CHUKO15111 745 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ACTN2P35609 894 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 GYS2P54840 703 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 EPSTI1Q96J88 318 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC171Q6TFL3 1326 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ZSCAN12O43309 604 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ADCY5O95622 1261 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CAVIN2O95810 425 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SKILP12757 684 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CASTP20810 708 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 LAMB3Q13751 1172 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 MAP7Q14244 749 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MORC4Q8TE76 937 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC192P0DO97 292 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 DMPKQ09013 629 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC96Q2M329 555 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TTC14Q96N46 770 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TMED1Q13445 227 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC57Q2TAC2 916 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 HYPKQ9NX55 129 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM66O15016 1216 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 PLIN1O60240 522 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MCM3P25205 808 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 PCK1P35558 622 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MYBPC2Q14324 1141 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SRLQ86TD4 932 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TEKT1Q969V4 418 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ENO4A6NNW6 628 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 E2F6O75461 281 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 BRD1O95696 1058 aa6.45□□□□□ -1.38
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