RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431558.1

PRRT3-AS1-201, PRRT3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRT3-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DDR1Q08345 913 aa21.71■■□□□ 1.07
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RALBP1Q15311 655 aa21.71■■□□□ 1.07
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.7■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.7■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 COL15A1P39059 1388 aa21.7■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZPR1O75312 459 aa21.69■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 STARD3NLO95772 234 aa21.69■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TM4SF1P30408 202 aa21.69■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.69■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NARFQ9UHQ1 456 aa21.69■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.69■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.68■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 A0A0G2JLW4 131 aa21.68■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.68■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TGFB2P61812 414 aa21.67■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.66■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 A1BGP04217 495 aa21.66■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 USP16Q9Y5T5 823 aa21.66■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DPEP1P16444 411 aa21.65■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.65■■□□□ 1.06
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NFIXQ14938 502 aa21.64■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NEFMP07197 916 aa21.63■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NFE2L2Q16236 605 aa21.63■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KCNA3P22001 575 aa21.62■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 A0A087WZG4 1122 aa21.61■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.61■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BCS1LQ9Y276 419 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.58■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SERPINB2P05120 415 aa21.58■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CHRNA5P30532 468 aa21.58■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.58■■□□□ 1.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.58■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NBPF26B4DH59 902 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CAMTA2O94983 1202 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NBPF15Q8N660 670 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.55■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SCN7AQ01118 1682 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RIPK4P57078 832 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PIM2Q9P1W9 311 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.52■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ATP10DQ9P241 1426 aa21.52■■□□□ 1.04
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ADCY9O60503 1353 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BCORQ6W2J9 1755 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NEUROD2Q15784 382 aa21.48■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.48■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.48■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RUNDC1Q96C34 613 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SETDB2Q96T68 719 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.46■■□□□ 1.03
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NGEFQ8N5V2 710 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C1QTNF8P60827 252 aa21.44■■□□□ 1.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HLFQ16534 295 aa21.44■■□□□ 1.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.44■■□□□ 1.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 H0YIN7 160 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TTLL6Q8N841 843 aa21.42■■□□□ 1.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CNBD1Q8NA66 436 aa21.42■■□□□ 1.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MYL6BP14649 208 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 218.8 ms