RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NFE2L2Q16236 605 aa21.45■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.45■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.44■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL15A1P39059 1388 aa21.44■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A087WZG4 1122 aa21.41■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GRIN3BO60391 1043 aa21.41■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.41■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNQ3O43525 872 aa21.4■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NARFQ9UHQ1 456 aa21.4■■□□□ 1.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.39■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FKBP8Q14318 412 aa21.39■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.37■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RIPK4P57078 832 aa21.37■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TGFB2P61812 414 aa21.36■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.36■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.35■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.35■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.35■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A1BGP04217 495 aa21.34■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RUNDC1Q96C34 613 aa21.34■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP16Q9Y5T5 823 aa21.33■■□□□ 1.01
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHD4Q14839 1912 aa21.32■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDR1Q08345 913 aa21.32■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NEUROD2Q15784 382 aa21.32■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.32■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TM4SF1P30408 202 aa21.31■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NFIXQ14938 502 aa21.31■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.31■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.31■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.31■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.3■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A0G2JLW4 131 aa21.3■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.3■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.3■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NPHP1O15259 732 aa21.29■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BCS1LQ9Y276 419 aa21.29■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SERPINB2P05120 415 aa21.28■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.28■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.28■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.28■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANP32CO43423 234 aa21.27■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DPEP1P16444 411 aa21.27■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SCN7AQ01118 1682 aa21.27■■□□□ 1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.25■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.25■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SETDB2Q96T68 719 aa21.25■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.25■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIM2Q9P1W9 311 aa21.25■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.24■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CAMTA2O94983 1202 aa21.24■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.22■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NGEFQ8N5V2 710 aa21.22■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NBPF26B4DH59 902 aa21.21■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHRNA5P30532 468 aa21.21■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.21■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NBPF15Q8N660 670 aa21.21■□□□□ 0.99
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYL6BP14649 208 aa21.2■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ST5P78524 1137 aa21.2■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.2■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CNBD1Q8NA66 436 aa21.2■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BCORQ6W2J9 1755 aa21.2■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 H0YIN7 160 aa21.19■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.19■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.19■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.18■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDE6BP35913 854 aa21.18■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.18■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MRS2Q9HD23 443 aa21.18■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ERBB4Q15303 1308 aa21.18■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 APAF1O14727 1248 aa21.17■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RGL2O15211 777 aa21.17■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNA3P22001 575 aa21.17■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms