RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 MTHFSP49914 203 aa14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNF181Q9P0P0 153 aa14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZPR1O75312 459 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 FSTL1Q12841 308 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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APOBEC3C-202ENST00000428892 KLRG1Q96E93 195 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 RRAGCQ9HB90 399 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNA3P22001 575 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHRNA5P30532 468 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 HTRA3P83110 453 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 IL13P35225 146 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 CACNA1SQ13698 1873 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 DDR1Q08345 913 aa14.61□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.61□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 CAPN15O75808 1086 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 RASSF7Q02833 373 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 COL15A1P39059 1388 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.57□□□□□ -0.08
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APOBEC3C-202ENST00000428892 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 LMNB1P20700 586 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPP2R1AP30153 589 aa14.56□□□□□ -0.08
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APOBEC3C-202ENST00000428892 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRC1P22897 1456 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 TM4SF1P30408 202 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 NARFQ9UHQ1 456 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 H0YIN7 160 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 SERPINB2P05120 415 aa14.54□□□□□ -0.08
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APOBEC3C-202ENST00000428892 TTLL6Q8N841 843 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCN7AQ01118 1682 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.53□□□□□ -0.08
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APOBEC3C-202ENST00000428892 NPHP1O15259 732 aa14.53□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC39A6Q13433 755 aa14.53□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.53□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.53□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.53□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.53□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
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APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 LGR6Q9HBX8 967 aa14.51□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.5□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A087WZG4 1122 aa14.5□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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APOBEC3C-202ENST00000428892 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.49□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 STARD3NLO95772 234 aa14.49□□□□□ -0.09
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APOBEC3C-202ENST00000428892 CFAP53Q96M91 514 aa14.48□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.48□□□□□ -0.09
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APOBEC3C-202ENST00000428892 RALBP1Q15311 655 aa14.47□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 ERFEQ4G0M1 354 aa14.47□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 PCNTO95613 3336 aa14.47□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 NFKBIEO00221 500 aa14.46□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 C21orf2O43822 256 aa14.46□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 TEFQ10587 303 aa14.46□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
APOBEC3C-202ENST00000428892 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.46□□□□□ -0.09
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