RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APLP1P51693 650 aa17.89■□□□□ 0.45
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa17.7■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRIP1Q9BX63 1249 aa17.69■□□□□ 0.42
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa17.69■□□□□ 0.42
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP17.69■□□□□ 0.42
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC24Q8N4L8 307 aa17.68■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTBD11A6QL63 1104 aa17.67■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A1BGP04217 495 aa17.67■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKAR2BP31323 418 aa17.67■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNBD1Q8NA66 436 aa17.67■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHACTR3Q96KR7 559 aa17.67■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSPH6AQ9H0K4 717 aa17.67■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCNTO95613 3336 aa17.66■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNQ3O43525 872 aa17.66■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C21orf2O43822 256 aa17.66■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP53Q96M91 514 aa17.66■□□□□ 0.42
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